C型产气荚膜梭菌感染鹿肠道中关键基因和途径的转录组分析 |
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作者姓名: | 王美慧 钟震宇 白加德 单云芳 程志斌 张庆勋 孟玉萍 董玉兰 郭青云 |
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作者单位: | 1. 中国农业大学动物医学院;2. 北京麋鹿生态实验中心;3. 北京市科学技术研究院创新发展战略研究所 |
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基金项目: | 北京市科学技术研究院北科萌芽项目(BGS202108);;北京市自然科学基金(6194031); |
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摘 要: | 鹿的产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens,C.perfringens)病主要表现为肠毒血症,致死率高。本研究旨在探究C型产气荚膜梭菌感染鹿肠道的关键基因和途径。通过构建C型产气荚膜梭菌感染鹿空肠结扎环模型,HE染色检测C型产气荚膜梭菌感染后空肠的病理学变化,采用Illumina NovaSeq对C型产气荚膜梭菌感染鹿肠道进行转录组测序,并利用qPCR技术进一步验证部分差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs);最后通过STRING网站预测多基因蛋白互作网络。结果显示:形态学分析显示,产气荚膜梭菌感染后鹿肠道组织出现明显的坏死和出血。转录组分析显示,一共存在705个差异表达基因,其中,在感染组肠道中有276个上调的差异基因,有429个下调的差异基因。GO富集分析显示,DEGs主要富集在生物调节、对刺激的反应和免疫系统过程;KEGG富集分析显示,DEGs富集的通路主要是T细胞受体信号传导途径、Toll样受体信号通路和造血细胞谱系等,造成肠道损伤和出血,促进鹿肠毒血症的进程。此外,qPCR结果证实了分析结果准确可信。DEG...
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关 键 词: | C型产气荚膜梭菌 肠毒血症 空肠结扎环模型 鹿 转录组分析 |
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