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基于转录组测序探究地塞米松在前体脂肪细胞成脂分化过程中的作用机制
作者姓名:杨涛  周佳伟  张宇  徐忠  吴俊静  乔木  冯越  李梓芃  彭先文  周焕焕  陈洪波  徐珂  梅书棋
作者单位:1. 武汉轻工大学动物科学与营养工程学院湖北省家畜种业技术创新中心;2. 动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,湖北省农业科学院畜牧兽医研究所
基金项目:国家自然科学基金项目(32102527);;动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室开放课题(KLAEMB-2023-01);;国家重点研发计划项目(2022YFF1001300);
摘    要:试验旨在研究地塞米松(DEX)在前体脂肪细胞成脂分化过程中的作用机制,为后续体外研究猪肌内脂肪(IMF)沉积的调控机制奠定前期基础。试验分别使用DEX及常用成脂诱导剂MDI(3-异丁基-1-甲基黄嘌呤0.5 mmol/L、地塞米松1μmol/L、胰岛素10μg/mL)处理3T3-L1细胞,利用GO Term和KEGG PATHWAY对差异基因进行功能及信号通路分析。结果发现:相比阴性对照组,MDI组和DEX组分别筛选到2280个、1188个差异表达基因,差异基因富集到血管相关平滑肌收缩、脂质生物合成、脂肪细胞分化等生物学过程;对2处理组间的差异基因集进行Venn分析,获得779个共有差异表达基因,其中上下调模式一致的差异表达基因751个,且显著富集到脂肪细胞分化、脂肪酸代谢过程和PPAR信号通路等。本研究鉴定出通过DEX诱导前体脂肪细胞成脂分化过程的关键基因Selenbp1、Arid5b、Rgs2、Metrnl、Acsl6、Hmgcs1等。

关 键 词:成脂分化  地塞米松  转录组测序  信号通路  
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