| 鸡繁殖性状近交衰退相关lncRNA的筛选 |
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| 引用本文： | 薛倩,李国辉,邢伟杰,周成浩,张会永,殷建玫,朱云芬,曹愉夏,苏一军,韩威.鸡繁殖性状近交衰退相关lncRNA的筛选[J].中国畜牧兽医,2022,49(6):2176-2185. |
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| 作者姓名： | 薛倩 李国辉 邢伟杰 周成浩 张会永 殷建玫 朱云芬 曹愉夏 苏一军 韩威 |
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| 作者单位： | 1. 江苏省家禽科学研究所科技创新有限公司, 扬州 225125;2. 江苏省家禽科学研究所, 扬州 225125 |
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| 基金项目： | 江苏省重点研发计划（现代农业）专项（BE2019353）；江苏省种业振兴揭榜挂帅"种质资源优异功能基因挖掘及生物育种核心技术攻关"项目（JBGS[2021]029） |
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| 摘 要： | 【目的】 筛选与鸡繁殖性状近交衰退相关的长链非编码RNA （long non-coding RNA，lncRNA），为深入探究lncRNA对鸡繁殖性能近交衰退调控机制提供参考。【方法】 以狼山鸡高、低近交群体为试验素材，通过转录组测序技术分析狼山鸡下丘脑和卵巢中lncRNA表达情况，筛选高、低近交组间差异表达lncRNA，并对其进行顺式调控靶基因预测及功能分析。【结果】 狼山鸡下丘脑和卵巢中共鉴定出4 222个lncRNAs，高、低近交组间比较发现，下丘脑中差异表达lncRNAs 35个，卵巢中差异表达lncRNAs 215个。下丘脑中差异lncRNAs中预测到顺式调控靶基因98个，这些靶基因显著富集于出生或孵化时胚胎发育终止、胚胎心导管发育、视黄酸应答等繁殖相关生物过程（P<0.05），涉及lncRNA MSTRG.9196.4、MSTRG.9195.2、MSTRG.6254.2以及相应靶基因DNAAF2和FKBP1B等胚胎发育相关基因；卵巢中差异lncRNAs预测到顺式调控靶基因414个，这些靶基因富集到卵母细胞减数分裂、MAPK、叶酸合成等信号通路，包括MSTRG.7683.1、MSTRG.13604.4、MSTRG.16570.1、MSTRG.8330.5、MSTRG.8330.4等神经内分泌调节及配子生成相关的lncRNAs。【结论】 本研究在下丘脑和卵巢中筛选到了一系列鸡胚胎发育及配子生成调控相关差异lncRNAs，这些lncRNAs可作为鸡繁殖性能近交衰退候选lncRNAs，为进一步揭示鸡繁殖性能近交衰退调控机制提供线索。
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| 关 键 词： | 鸡 繁殖性状 近交衰退 差异表达 长链非编码RNA(lncRNA) 靶基因 |
| 收稿时间： | 2021-11-03 |
Screening of lncRNA Related to Inbreeding Depression of Reproduction in Chickens |
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| XUE Qian,LI Guohui,XING Weijie,ZHOU Chenghao,ZHANG Huiyong,YIN Jianmei,ZHU Yunfen,CAO Yuxia,SU Yijun,HAN Wei.Screening of lncRNA Related to Inbreeding Depression of Reproduction in Chickens[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2022,49(6):2176-2185. |
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| Authors: | XUE Qian LI Guohui XING Weijie ZHOU Chenghao ZHANG Huiyong YIN Jianmei ZHU Yunfen CAO Yuxia SU Yijun HAN Wei |
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| Institution: | 1. Science and Technology Innovation Co., Ltd., Poultry Institute of Jiangsu Province, Yangzhou 225125, China;2. Poultry Institute of Jiangsu Province, Yangzhou 225125, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | chickens reproductive traits inbreeding depression differential expression long non-coding RNA (lncRNA) target gene |
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