| 静原鸡let-7a-5p的靶基因预测及组织表达分析 |
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| 引用本文： | 邓占钊,禹保军,曹国伟,张娟,石永宏,胡伟龙,仇秀玲. 静原鸡let-7a-5p的靶基因预测及组织表达分析[J]. 中国畜牧兽医, 2022, 49(10): 3704-3712. DOI: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2022.10.002 |
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| 作者姓名： | 邓占钊 禹保军 曹国伟 张娟 石永宏 胡伟龙 仇秀玲 |
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| 作者单位： | 1. 彭阳县畜牧技术推广服务中心, 固原 756599;2. 宁夏大学农学院, 银川 750021;3. 宁夏九三零生态农牧有限公司, 银川 750021 |
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| 基金项目： | 宁夏回族自治区重点研发计划项目"宁夏静原鸡种质资源发掘及产业化配套关键技术研究与示范"(2022BBF02034) |
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| 摘 要： | 【目的】了解let-7a-5p的生物学信息，初步探索其在静原鸡肌肉组织中的功能作用。【方法】利用生物信息学方法对转录组测序获得的静原鸡let-7a-5p的成熟序列进行保守性分析，使用miRDB、TargetScan和miRanda在线软件预测let-7a-5p的靶基因，取其交集进行GO功能和KEGG通路富集分析，并利用实时荧光定量PCR检测let-7a-5p在静原鸡公鸡和母鸡各组织中的表达水平。【结果】let-7a-5p的成熟序列在各物种间高度保守，共预测得到38个基因集合。在生物过程、细胞组分和分子功能中靶基因富集较多的GO条目有细胞过程、生物调节、细胞、结合和催化活性；靶基因显著富集于聚酮糖单元生物合成、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、泛素介导的蛋白水解、TGF-β信号通路和加压素调节的水重吸收信号通路，且富集最多的是代谢途径、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症中的作用、泛素介导的蛋白水解和MAPK信号通路。let-7a-5p-靶基因互作主要通过作用于靶mRNA的3′-UTR抑制表达或使其降解。组织表达发现，let-7a-5p在静原鸡公、母鸡的心脏、肝脏、脾脏、...
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| 关 键 词： | 静原鸡 let-7a-5p 靶基因 生物信息学 组织表达谱 |
| 收稿时间： | 2022-04-12 |
Target Gene Prediction and Tissue Expression Analysis of let-7a-5p in Jingyuan Chickens |
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| DENG Zhanzhao,YU Baojun,CAO Guowei,ZHANG Juan,SHI Yonghong,HU Weilon,QIU Xiuling. Target Gene Prediction and Tissue Expression Analysis of let-7a-5p in Jingyuan Chickens[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2022, 49(10): 3704-3712. DOI: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2022.10.002 |
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| Authors: | DENG Zhanzhao YU Baojun CAO Guowei ZHANG Juan SHI Yonghong HU Weilon QIU Xiuling |
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| Affiliation: | 1. Pengyang County Animal Husbandry Technology Extension Service Center, Guyuan 756599, China;2. College of Agriculture, Ningxia University, Yinchuan 750021, China;3. Ningxia Jiusan Zero Ecological Farming and Animal Husbandry Co., Yinchuan 750021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Jingyuan chickens let-7a-5p target gene bioinformatics tissue expression profile |
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