兔眼越橘新梢转录组测序与分析 |
| |
引用本文: | 张长青,李海玲,李广平.兔眼越橘新梢转录组测序与分析[J].西北农业学报,2015,24(12):100-107. |
| |
作者姓名: | 张长青 李海玲 李广平 |
| |
作者单位: | (1.金陵科技学院 园艺学院,南京 210038; 2.南京林业大学 林学院,南京 210037) |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金(31171273);江苏省“333人才工程”(BRA2014003)。 |
| |
摘 要: | 为研究兔眼越橘新梢中基因转录和抗氧化物代谢相关通路的基因表达,利用Illumina Solexa技术和生物信息学方法对兔眼越橘品种‘粉蓝’新梢进行转录组测序分析。结果表明,测序数据组装后共获得64 185条单体序列;将其与COG、KEGG、GO、NR和Swiss-Prot数据库比对后发现,共有37 900条单体与葡萄、桃、番茄、蓖麻、毛果杨、草莓等物种的基因具有同源性;基于COG数据库分析后可见,12 559条序列可归属其中,而转录类、复制-重组-修复类、翻译后修饰-蛋白质周转-分子伴侣类位居前列;基于KEGG数据库分析发现,19条抗氧化相关代谢通路中,黄酮类、苯丙素类代谢通路是活跃通路,叶酸类、类胡萝卜素、二苯乙烯类、二芳基庚酸类、姜酚、二萜类化合物的合成通路是部分支路活跃,而其他抗氧化相关通路基本无法产生预期功能成分。
|
关 键 词: | 越橘 新梢 转录组 抗氧化物代谢 |
本文献已被 CNKI 等数据库收录! |
| 点击此处可从《西北农业学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《西北农业学报》下载免费的PDF全文 |
|