黑守瓜中一种新negevirus的鉴定和分析 |
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作者姓名: | 王海强 张岩 叶庄新 卓继冲 张传溪 李俊敏 陈剑平 |
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作者单位: | 宁波大学植物病毒学研究所农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室/农业农村部和浙江省植物保护生物技术重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金联合基金项目(U20A2036); |
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摘 要: | negevirus(nege-like virus)是病毒学领域新增的一个分类单元,主要包括在节肢动物中鉴定的一类昆虫特异性病毒。本研究利用宏转录组技术从黑守瓜(Aulacophora lewisii)中鉴定到一种新的negevirus,命名为Nbu Aulacophora lewisii nege-like virus 1(NbuALNV-1)。NbuALNV-1为正义单链RNA病毒,全基因组包含9 832个核苷酸(nucleotide, nt)(不包括多聚腺苷酸尾),5′、3′非翻译区长度分别为292、77 nt。NbuALNV-1基因组包含6个开放阅读框,预测具有5个典型的negeviruses保守结构域,包括病毒甲基转移酶结构域、RNA病毒解旋酶结构域、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, RdRp)结构域、DISB-ORF2_chro结构域和SP24结构域。本研究利用NbuALNV-1和已报道的negeviruses的RdRp氨基酸序列基于最大似然法构建的系统发育分析表明,NbuALNV-1与Hubei Wuhan insect...
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关 键 词: | negeviruses 新病毒鉴定 干扰小RNA 黑守瓜 |
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