2016—2020年浙江地区猪圆环病毒2型分子流行病学分析

为了解猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV2)在浙江地区的流行病学特点和遗传变异规律，本研究采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)对2016—2020年采自浙江省不同地区猪场的1 725份疑似猪圆环病毒2型感染的临床病料进行PCV2的病原学检测，同时对部分阳性样品进行全基因组扩增、克隆和测序，并与Gen Bank中收录的16株参考株序列进行比对和遗传进化分析。结果表明：PCV2检测阳性的样品有359份，平均阳性率为20.8%,2016—2020年PCV2阳性率分别为38.1%、23.2%、24.1%、12.5%和10.7%；测序所得PCV2 36个全基因序列的核苷酸同源性为94.0%～99.9%，与国产疫苗株核苷酸同源性为94.7%～98.5%，与参考株核苷酸同源性为92.9%～99.8%；遗传进化分析显示PCV2 36个全基因序列可分为3个基因型，其中11株为PCV2a型，8株为PCV2b型，17株为PCV2d型，PCV2d为优势基因型；ORF2基因全长分别为705 bp(16株)和702 bp(20株)，...