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| 奥利亚罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析 | |
| 引用本文： | 蒋宗良,张明,林勇,朱佳杰,黎明星,罗永巨,甘西. 奥利亚罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析[J]. 中国水产科学, 2011, 18(4): 790-800. DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.00790 |
| 作者姓名： | 蒋宗良 张明 林勇 朱佳杰 黎明星 罗永巨 甘西 |
| 作者单位： | 1. 广西水产研究所,广西南宁 530004;广西大学动物繁殖研究所,广西南宁 530004 2. 广西大学动物繁殖研究所,广西南宁,530004 3. 广西水产研究所,广西南宁,530004 |
| 基金项目： | 农业部公益性行业科研项目专项，广西科学基金资助项目，现代农业产业技术体系 |
| 摘 要： | 采用LA-PCR(long amplification polymerase chain reaction)扩增方法获得奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)线粒体基因组全序列.分析表明,序列全长16 632 bp,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个长度为931 bp的主非编码区.A、T、G、C碱基的组成分别为27.89％、25.50％、15.62％、30.99％.基因排列与罗非鱼属的其他物种一致.13个蛋白质基因除COX1用TGT做起始密码子外,其他均以ATG为起始,终止密码子除COX2、Cyt b、ND4为不完整的T,其余基因均以典型的TAA做终止密码子.22个tRNA的二级结构都具有典型三叶草结构.系统发育分析显示,罗非鱼属与丽鱼科(Cichlidae)其他物种分开,聚为单系群,其中奥利亚罗非鱼与尼罗罗非鱼亲缘关系较近,莫桑比克非鱼和罗非鱼KM-2006亲缘关系较近.本研究旨在为进一步利用线粒体基因组分析罗非鱼群体遗传多样性、亲缘关系以及丽鱼科系统进化提供基础依据. |
| 关 键 词： | 奥利亚罗非鱼 线粒体基因组 序列分析 系统进化 |
| 修稿时间： | 2011-08-19 |
Complete mitochondrial genome sequence and phylogenetic analysis of Oreochromis aureus |
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| JIANG Zongliang,ZHANG Ming,LIN Yong,ZHU Jiajie,LI Mingxing,LUO Yongju,GAN Xi. Complete mitochondrial genome sequence and phylogenetic analysis of Oreochromis aureus [J]. Journal of Fishery Sciences of China, 2011, 18(4): 790-800. DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.00790 | |
| Authors: | JIANG Zongliang ZHANG Ming LIN Yong ZHU Jiajie LI Mingxing LUO Yongju GAN Xi |
| Affiliation: | JIANG Zongliang1,2,ZHANG Ming2,LIN Yong1,ZHU Jiajie1,LI Mingxing2,LUO Yongju1,GAN Xi1 1.Guangxi Institute of Fisheries,Nanning 530021,China,2.Animal Reproduction Institute,Guangxi University,Nanning 530004 |
| Abstract: | The complete mitochondrial genome of Oreochromis aureus was obtained using long amplification po-lymerase chain reaction(LA-PCR) and sequenced.The total length of the sequence was 16 632 bp,and includes 13 protein-coding genes,two ribosomal RNA genes,22 transfer RNA genes,and a 931 bp major non-coding re-gion.The nucleotide composition was 27.89%(A),25.50%(T),15.62%(C),and 30.99%(G).The arrangement of genes in Oreochromis aureus was identical to that of other Tilapiini.The COX1 gene uses TGT as an initiatio... |
| Keywords: | Oreochromis aureus mitochondrial genome sequence analysis phylogenetic tree |
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