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利用重测序的染色体片段代换系群体定位水稻粒型QTL
引用本文:徐建军,赵强,汤在祥,赵元凤,朱磊,徐辰武,顾铭洪,韩斌,梁国华.利用重测序的染色体片段代换系群体定位水稻粒型QTL[J].中国水稻科学,2011,25(4):365-369.
作者姓名:徐建军  赵强  汤在祥  赵元凤  朱磊  徐辰武  顾铭洪  韩斌  梁国华
作者单位:1. 扬州大学教育部植物功能基因组学重点实验室/江苏省作物遗传生理国家重点实验室,江苏 扬州225009;上海市松江区农业技术推广中心,上海 201613
2. 中国科学院植物生理生态研究所,上海,200233
3. 扬州大学教育部植物功能基因组学重点实验室/江苏省作物遗传生理国家重点实验室,江苏 扬州,225009
基金项目:国家973计划资助项目
摘    要: 以一套用籼稻品种9311为受体、粳稻品种日本晴为供体构建的128个染色体片段代换系为材料,按随机区组实验设计种植,于成熟后考查代换系粒长、粒宽性状,利用多元回归分析方法,结合Bin图谱,鉴定出6个与粒长相关的QTL、2个与粒宽相关的QTL。其中,qGL3.1被定位在水稻第3染色体的5 792 954 bp区间内;qGL3.2被定位在第3染色体的917 878 bp区间内;qGL8.1被定位在第8染色体的889 543 bp区间内;qGL8.2被定位在第8染色体的208 614 bp区间内;qGL9.1被定位在第9染色体的1 149 685 bp区间内;qGL11.1被定位在第11染色体的3 184 760 bp区间内;qGW1.1被定位在第1染色体的200 070 bp区间内;qGW5.1被定位在第5染色体的704 905 bp区间内。上述QTL的准确定位,为进一步精细定位及克隆相应QTL和开展水稻粒型分子育种奠定了基础。

关 键 词:水稻  粒型  染色体片段代换系  数量性状基因座
收稿时间:2010-10-29;

Mapping of QTLs for Grain Shape Using Whole-Genome Resequenced Chromosome Segment Substitution Lines in Rice
XU Jian-jun,ZHAO Qiang,TANG Zai-xiang,ZHAO Yuan-feng,ZHU Lei,Xu Chen-wu,Gu Ming-hong,HAN Bin,LIANG Guo-hua.Mapping of QTLs for Grain Shape Using Whole-Genome Resequenced Chromosome Segment Substitution Lines in Rice[J].Chinese Journal of Rice Science,2011,25(4):365-369.
Authors:XU Jian-jun  ZHAO Qiang  TANG Zai-xiang  ZHAO Yuan-feng  ZHU Lei  Xu Chen-wu  Gu Ming-hong  HAN Bin  LIANG Guo-hua
Institution:XU Jian-jun1,2,ZHAO Qiang3,TANG Zai-xiang1,ZHAO Yuan-feng1,ZHU Lei1,XU Chen-wu1,GU Ming-hong1,HAN Bin3,LIANG Guo-hua1(1Jiangsu Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology /Key Laboratory of Plant Function Genomics,Ministry of Education,Yangzhou University,Yangzhou 225009,China,2Songjiang Agricultural Technology and Popularization Center of Shanghai,Shanghai 201613,3Institute of Plant Physiology and Ecology,Chinese Academy of Sciences,Shanghai 200233,China)
Abstract:One hundred and twenty-eight chromosome segment substitution lines derived from 9311 as recipient and Nipponbare as donor,were used for mapping QTLs for grain shape by combining the sequencing-based Bin-map with a multiple linear regression analysis.Six and two QTLs were identified for grian length(GL) and grian width(GW),respectively.qGL3.1 was mapped in a region of 5 792 954 bp on chromosome 3,qGL3.2 in a region of 917 878 bp on chromosome 3;qGL8.1 in a region of 889 543 bp on chromosome 8;qGL8.2 in a reg...
Keywords:rice  grain shape  chromosome segment substitution lines  quantitative trait locus  
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