| 郑麦369 ω-醇溶蛋白基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 柳东阳,周正富,吴政卿,李文旭,晁岳恩,徐福新,雷振生.郑麦369 ω-醇溶蛋白基因的克隆及生物信息学分析[J].河南农业大学学报,2020,54(1):11-18. |
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| 作者姓名： | 柳东阳 周正富 吴政卿 李文旭 晁岳恩 徐福新 雷振生 |
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| 作者单位： | 河南农业大学,河南 郑州450002,河南省农业科学院小麦研究所,河南 郑州450002,河南省农业科学院小麦研究所,河南 郑州450002,河南省农业科学院小麦研究所,河南 郑州450002,河南省农业科学院小麦研究所,河南 郑州450002,河南省农业科学院小麦研究所,河南 郑州450002,河南农业大学,河南 郑州450002;河南省农业科学院小麦研究所,河南 郑州450002 |
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| 基金项目： | 河南省中原学者项目;河南省现代农业产业技术体系建设项目;河南省科技攻关计划;国家科技重大专项;国家重点研发计划 |
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| 摘 要： | 以黄淮麦区主推小麦品种郑麦369为材料,利用简并引物和PCR扩增技术对其ω-醇溶蛋白基因进行克隆,获得15条ω-醇溶蛋白核苷酸序列(分别命名为ZM369-1～ZM369-15)。NCBI BLAST分析表明,克隆序列与已知序列的相似度均为82%～99%,推断其为ω-醇溶蛋白基因家族基因。通过FGENESH在线软件预测显示,ZM369-1和ZM369-15具有完整的开放阅读框,分别可编码318,407个氨基酸残基;其余13条序列均因内部提前出现1个或多个终止密码子,推测其为假基因。进一步分析显示,15个基因推导的氨基酸序列均具有ω-醇溶蛋白典型分子结构特征,其中ZM369-15属于未曾报道过的ARP类型,同时在重复区存在1个半胱氨酸残基的插入。此外,在NCBI数据库中没有找到与ZM369-1和ZM369-15相似度高的ω-醇溶蛋白氨基酸序列,推测其为新ω-醇溶蛋白基因。CD免疫肽识别分析表明,免疫肽段Gli-ωt在15条氨基酸序列中均有分布,免疫肽段Gli-ω1只分布于假基因推导得到的氨基酸序列中。系统进化树分析表明,本研究克隆得到的15个基因分别来源于A,D基因组;相同基因组来源的ω-醇溶蛋白基因大都可形成相对集中的分支,表明其具有一定的基因组特异性;相同类型ω-醇溶蛋白基因都能形成相对集中的分支,推测其类型与进化有关。
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| 关 键 词： | 小麦 ω-醇溶蛋白 基因克隆 生物信息学 |
Cloning and bioinformatic analysis of ω-gliadin genes in Zhengmai 369 |
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| LIU Dongyang,ZHOU Zhengfu,WU Zhengqing,LI Wenxu,CHAO Yueen,XU Fuxin,LEI Zhensheng.Cloning and bioinformatic analysis of ω-gliadin genes in Zhengmai 369[J].Journal of Henan Agricultural University,2020,54(1):11-18. |
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| Authors: | LIU Dongyang ZHOU Zhengfu WU Zhengqing LI Wenxu CHAO Yueen XU Fuxin LEI Zhensheng |
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