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基于转录组分析的九种苍耳分子标记筛选和鉴定
引用本文:王书平,梅洋,傅怡宁,田雯,蒋费涛,李昂,张宁,王寅鹏,印丽萍.基于转录组分析的九种苍耳分子标记筛选和鉴定[J].植物保护学报,2021,48(6):1488-1495.
作者姓名:王书平  梅洋  傅怡宁  田雯  蒋费涛  李昂  张宁  王寅鹏  印丽萍
作者单位:上海海关动植物与食品检验检疫技术中心, 上海 200135;浙江大学农业生物与技术学院, 杭州 310012;江阴海关, 江苏 江阴 214442;上海海关动植物与食品检验检疫技术中心, 上海 200135;天津市北辰区生态环境保护综合行政执法支队, 天津 300400;上海海关动植物检疫处, 上海 200082
基金项目:国家自然科学基金(3190195),海关总署科技项目(2020HK166)
摘    要:为实现我国非重要的检疫性杂草——苍耳属Xanthium杂草快速高效的分子鉴定,利用Illumina二代测序平台对白苍耳X.albinum、意大利苍耳X.italicum、直刺苍耳X.ripicola、刺苍耳X.spinosum、柱果苍耳X.cylindricum、宾州苍耳X.pennsylvanicum、蝟实苍耳X.echinatum、苍耳X.sibiricum和北美苍耳X.strumarium共9种苍耳属杂草进行转录组测序,获得的unigene序列数分别为103 362、93 506、87 452、83 822、70 994、66 397、57 598、57 164和57 134个。利用生物信息分析方法对9种苍耳属杂草转录组进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)和物种间的特异性序列预测和筛选。经过PCR试验验证,筛选获得了可以有效鉴定上述9种杂草的6对SSR引物和13对特异性引物,提高了苍耳属杂草鉴定的准确率。

关 键 词:苍耳  快速鉴定  简单重复序列  特异性序列
收稿时间:2021/9/25 0:00:00
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