基于转录组分析的九种苍耳分子标记筛选和鉴定 |
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引用本文: | 王书平,梅洋,傅怡宁,田雯,蒋费涛,李昂,张宁,王寅鹏,印丽萍.基于转录组分析的九种苍耳分子标记筛选和鉴定[J].植物保护学报,2021,48(6):1488-1495. |
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作者姓名: | 王书平 梅洋 傅怡宁 田雯 蒋费涛 李昂 张宁 王寅鹏 印丽萍 |
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作者单位: | 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心, 上海 200135;浙江大学农业生物与技术学院, 杭州 310012;江阴海关, 江苏 江阴 214442;上海海关动植物与食品检验检疫技术中心, 上海 200135;天津市北辰区生态环境保护综合行政执法支队, 天津 300400;上海海关动植物检疫处, 上海 200082 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(3190195),海关总署科技项目(2020HK166) |
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摘 要: | 为实现我国非重要的检疫性杂草——苍耳属Xanthium杂草快速高效的分子鉴定,利用Illumina二代测序平台对白苍耳X.albinum、意大利苍耳X.italicum、直刺苍耳X.ripicola、刺苍耳X.spinosum、柱果苍耳X.cylindricum、宾州苍耳X.pennsylvanicum、蝟实苍耳X.echinatum、苍耳X.sibiricum和北美苍耳X.strumarium共9种苍耳属杂草进行转录组测序,获得的unigene序列数分别为103 362、93 506、87 452、83 822、70 994、66 397、57 598、57 164和57 134个。利用生物信息分析方法对9种苍耳属杂草转录组进行简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)和物种间的特异性序列预测和筛选。经过PCR试验验证,筛选获得了可以有效鉴定上述9种杂草的6对SSR引物和13对特异性引物,提高了苍耳属杂草鉴定的准确率。
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关 键 词: | 苍耳 快速鉴定 简单重复序列 特异性序列 |
收稿时间: | 2021/9/25 0:00:00 |
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