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RNA二级结构预测算法的研究进展
引用本文:黄伊子,李都悦,刘伟,周玮. RNA二级结构预测算法的研究进展[J]. 湖南农业科学, 2014, 0(18)
作者姓名:黄伊子  李都悦  刘伟  周玮
作者单位:湖南农业大学植物保护学院植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室、湖南省生物农药与制剂加工工程技术研究中心,湖南长沙,410128
基金项目:国家自然科学基金青年项目,湖南省自然科学基金,湖南省科学技术厅科技计划项目,湖南农业大学大学生科技创新基金(团委)资助科研项目,湖南农业大学植物保护学院“大学生创新性实验计划项目”
摘    要:在简要介绍了RNA的基础知识之后,对RNA二级结构的定义、表示方法、数据库等内容进行了详细阐述,并重点探讨了RNA二级结构预测方法的原理、适用范围及优缺点。目前,传统的RNA二级结构预测方法有比较序列分析法和最小自由能算法;新进发展的算法有支持向量机算法、基于堆积协变信息与最小自由能算法、基于局部茎搜索的算法、基于快速动态权重匹配算法、免疫粒子群算法、基于茎区的自由能算法、质心法。经过预测精度、复杂度、预测假节能力的对比,发现基于堆积协变信息与最小自由能算法和基于快速动态权重匹配算法,预测结果比较理想。

关 键 词:RNA  RNA二级结构预测  算法  综述

Review of RNA Secondary Structure Prediction Algorithms
HUANG Yi-zi,LI Du-yue,LIU Wei,ZHOU Wei. Review of RNA Secondary Structure Prediction Algorithms[J]. Hunan Agricultural Sciences, 2014, 0(18)
Authors:HUANG Yi-zi  LI Du-yue  LIU Wei  ZHOU Wei
Abstract:
Keywords:RNA  RNA secondary structure prediction  algorithm  review
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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