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杏CCD1和CCD4启动子克隆及顺式作用元件分析
引用本文:冯 靖,杨 灿,卢娟芳,席万鹏.杏CCD1和CCD4启动子克隆及顺式作用元件分析[J].园艺学报,2020,47(5):939-952.
作者姓名:冯 靖  杨 灿  卢娟芳  席万鹏
作者单位:1西南大学园艺园林学院,重庆 400716;2南方山地园艺学教育部重点实验室,重庆 400715
基金项目:国家自然科学基金项目(31872046)
摘    要:以‘轮台小白杏’杏果实为材料,根据转录组数据库中的CCD1和CCD4基因片段,通过基因组步移法克隆了两个启动子pPaCCD1和pPaCCD4,获得了长度分别为2 233和1 838 bp的启动子序列。利用PlantCare数据库对启动子序列的顺式作用元件进行预测分析,结果表明两个启动子均含有多个光响应、脱落酸和茉莉酸甲酯等共有顺式作用元件,此外,PaCCD1启动子中含有刺激诱导和种子特异性调控等响应元件,PaCCD4启动子中含有赤霉素、低温和增强转录水平等响应元件,这暗示PaCCD1和PaCCD4的表达可能受光信号、激素和胁迫等多种信号的共同调节。为进一步确定其启动子核心区,基于基因结构特征与顺式作用元件的分布情况,分别构建两个不同长度缺失启动子与GUS基因融合的表达载体并瞬时转化烟草叶片。GUS活性检测发现,在PaCCD1的启动子上游–2 174 ~–1 700 bp、–1 700 ~–1 200 bp、–1 200 ~–600 bp区间内均包含影响启动子活性的顺式作用元件;PaCCD4启动子在上游–1 740 ~–1 200 bp和–1 200 ~–600 bp这两个区间内含有顺式作用元件,随着启动子片段的缺失,PaCCD1和PaCCD4的GUS活性逐渐减弱。PaCCD1的启动子核心区域在–1 200 ~ 2 174 bp区段内,PaCCD4的启动子核心区域在–1 200 ~ 1 740 bp区段内。

关 键 词:  CCD1  CCD4  启动子  功能分析  

Cloning and cis-acting Element Analysis of CCD1 and CCD4 Promoter in Apricot
FENG Jing,YANG Can,LU Juanfang,XI Wanpeng.Cloning and cis-acting Element Analysis of CCD1 and CCD4 Promoter in Apricot[J].Acta Horticulturae Sinica,2020,47(5):939-952.
Authors:FENG Jing  YANG Can  LU Juanfang  XI Wanpeng
Institution:1.College of Horticulture and Landscape Architecture,Southwest University,Chongqing 400716,China;2Key Laboratory of Horticulture Science for Southern Mountainous Regions,Ministry of Education,Chongqing 400715,China
Abstract:
Keywords:apricot  CCD1  CCD4  promoter  function analysis  
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