| 柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 王福生,余 洪,胡 洲,管德龙,张 盼,朱世平,赵晓春. 柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(1): 23-40. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0581 |
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| 作者姓名： | 王福生 余 洪 胡 洲 管德龙 张 盼 朱世平 赵晓春 |
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| 作者单位： | 1西南大学/中国农业科学院柑桔研究所，重庆400712；2国家柑桔工程技术研究中心，重庆400712；3陕西师范大学生命科学学院，西安710119 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-26）；重庆市现代山地特色高效农业技术体系创新团队建设计划项目；西南大学双一流学科建设项目；中国博士后科学基金项目（2017M622946）；重庆市博士后科研项目（XmT2018062） |
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| 摘 要： | 分析SAUR(Small auxin up-regulated RNA)基因家族在不同柑橘基因组中的数量、连锁群分布、基因结构、系统进化、基因表达模式等,从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SAUR基因。SAUR在基因组上分布不均,呈现明显的串联重复现象,基因家族成员的差异可能是由于串联重复和染色体大片段复制引起。大多数柑橘SAUR基因不含内含子,含有SAUR特有的4个保守motif。系统进化树分析显示,来源于拟南芥、水稻、番茄、马铃薯和柑橘的629个SAUR基因分为9组,每一组都含有5个物种的家族成员,并且同一个物种的SAUR基因具有较近的遗传距离。顺式元件分析表明,CclSAUR基因家族成员的上游序列含有光响应、转录因子结合、激素响应、伤害响应、低温响应、玉米素代谢和类黄酮生物合成相关的元件。q RT-PCR分析结果显示,大多数CclSAUR都能响应外源IAA和低温处理。
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| 关 键 词： | 柑橘属 SAUR基因家族 基因表达 全基因组鉴定 |
Genome-wide Analysis of SAUR Gene Family in Citrus |
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| WANG Fusheng,YU Hong,HU Zhou,GUAN Delong,ZHANG Pan,ZHU Shiping,ZHAO Xiaochun. Genome-wide Analysis of SAUR Gene Family in Citrus[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2020, 47(1): 23-40. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0581 |
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| Authors: | WANG Fusheng YU Hong HU Zhou GUAN Delong ZHANG Pan ZHU Shiping ZHAO Xiaochun |
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| Affiliation: | 1.Citrus Research Institute，Southwest University/Chinese Academy of Agricultural Sciences，Chongqing 400712，China；2National Citrus Engineering Research Center，Chongqing 400712，China；3College of Life Sciences，Shaanxi Normal University，Xi’an 710119，China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Citrus small auxin up-regulated RNA gene expression genome-wide analysis |
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