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四川地区猕猴桃病毒1的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析
引用本文:彭期定,吕 蕊,杨 婷,林宏辉,席德慧. 四川地区猕猴桃病毒1的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析[J]. 园艺学报, 2020, 47(1): 120-126. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0166
作者姓名:彭期定  吕 蕊  杨 婷  林宏辉  席德慧
作者单位:四川大学生命科学学院,生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都 610065
基金项目:国家自然科学基金项目(31270290,31772131);四川省应用基础项目(2019YJ0135);中央高校基础研究经费项目(SCU2019D013)
摘    要:为了明确近期新西兰报道的侵染猕猴桃的新病毒——猕猴桃病毒1(Actinidia virus 1,AcV-1)在四川地区猕猴桃上的发生情况及其分子特性,采用RT-PCR对来自四川6个地区疑似感染病毒的90份猕猴桃主栽品种‘红阳’和‘金果’的叶片样品进行检测。结果表明,22份样品为AcV-1阳性,检出率为24.4%。将获得的5个AcV-1分离物和已报道的新西兰分离物K75的外壳蛋白(coatprotein,CP)基因序列进行比对,结果表明,分离物间核苷酸序列和氨基酸序列的相似性分别为84.8%~97.1%和89.7%~99.6%,其中除邛崃分离物HYH5与新西兰分离物K75的核苷酸序列相似性较高(97.1%)外,其余4个分离物均低于91%。系统进化分析结果显示,这些分离物主要聚集在3个分支上,分离物HYH5与新西兰分离物K75位于同一分支,其余分离物位于另外2个分支。

关 键 词:猕猴桃  猕猴桃病毒1  RT-PCR  CP基因  分子特征

RT-PCR Detection and Sequence Analysis of Coat Protein Gene of Actinidia virus 1 from Sichuan Province
PENG Qiding,Lü Rui,YANG Ting,LIN Honghui,XI Dehui. RT-PCR Detection and Sequence Analysis of Coat Protein Gene of Actinidia virus 1 from Sichuan Province[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2020, 47(1): 120-126. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0166
Authors:PENG Qiding  Lü Rui  YANG Ting  LIN Honghui  XI Dehui
Affiliation:Key Laboratory of Bio-resource and Eco-environment of Ministry of Education,College of Life Sciences,Sichuan University,Chengdu 610065,China
Abstract:
Keywords:kiwifruit  Actinidia virus 1  RT-PCR  CP gene  molecular characterization  
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