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基于RAPD和SSR分子标记的家蚕部分实用品种多态性及其亲缘关系分析
引用本文:姜振,蔡明文,徐世清,房丽秀,司马杨虎. 基于RAPD和SSR分子标记的家蚕部分实用品种多态性及其亲缘关系分析[J]. 蚕业科学, 2010, 36(1): 157-164. DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2010.01.026
作者姓名:姜振  蔡明文  徐世清  房丽秀  司马杨虎
作者单位:苏州大学基础医学与生物科学学院,江苏苏州,215123;苏州大学基础医学与生物科学学院,江苏苏州,215123;苏州大学基础医学与生物科学学院,江苏苏州,215123;苏州大学基础医学与生物科学学院,江苏苏州,215123;苏州大学基础医学与生物科学学院,江苏苏州,215123
基金项目:国家自然科学基金项目(No.30571405);;留学回国人员科研启动基金项目(No.2006-331)
摘    要:分子标记是生物系统进化和亲缘关系分析的重要手段。利用RAPD和SSR标记对12个家蚕实用品种的基因组DNA进行多态性分析和聚类分析。采用21条RAPD引物对12个品种的基因组DNA扩增产生的清晰稳定条带数为196条,其中多态性片段143条,多态位点比例72.96%,品种间的遗传距离在0.157~0.352之间。采用32条SSR引物对12个品种的基因组DNA扩增产生的片段数为86条,其中多态性带80条,多态性位点比例93.02%,遗传距离在0.214~0.600之间。对12个家蚕品种的2种分子标记的单独聚类结果表现出一定差异,但均把12个品种分为中系、日系两大类,其中7532和湘晖、871和57B的亲缘关系较近,而传统分类于中系品种东34却聚类于日系,但又独立于其余6个日系品种。结合RAPD标记和SSR标记的12个品种间的遗传距离与聚类结果,更能准确地从分子水平上反映品种间的亲缘关系及其来源,是家蚕杂交育种亲本选择的依据。

关 键 词:家蚕实用品种  DNA多态性  随机扩增多态性DNA  简单重复序列

Analysis on DNA Polymorphism and Genetic Relationship of Several Commercial Silkworm Varieties Based on RAPD and SSR Molecular Markers
JIANG Zhen,CAI Ming-Wen,XU Shi-Qing,FANG Li-Xiu,SIMA Yang-Hu. Analysis on DNA Polymorphism and Genetic Relationship of Several Commercial Silkworm Varieties Based on RAPD and SSR Molecular Markers[J]. Acta Sericologica Sinica, 2010, 36(1): 157-164. DOI: 10.3969/j.issn.0257-4799.2010.01.026
Authors:JIANG Zhen  CAI Ming-Wen  XU Shi-Qing  FANG Li-Xiu  SIMA Yang-Hu
Affiliation:School of Basic Medicine and Biological Sciences;Soochow University;Suzhou Jiangsu 215123;China
Abstract:Molecular marker technique is an important method in studying phylogenetic evolution and genetic relationship of organisms.The DNA polymorphism of 12 commercial silkworm varieties was analyzed based on RAPD and SSR molecular markers.Subsequently,cluster analysis was conducted.By using 21 RAPD primers to amplify the genomic DNAs of 12 silkworm varieties,196 clearly distinguishable bands were obtained,among which 143 bands showed polymorphism,showing a polymorphism percentage of 72.96% and relative genetic di...
Keywords:Silkworm commercial variety  DNA polymorphism  Random amplified polymorphic DNA  Simple sequence repeat  
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