| 鹰嘴豆LHY基因cDNA克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 韩慧,王希东,姚正培,夏木斯亚·卡坎.鹰嘴豆LHY基因cDNA克隆及生物信息学分析[J].新疆农业大学学报,2014(4):321-326. |
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| 作者姓名： | 韩慧 王希东 姚正培 夏木斯亚·卡坎 |
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| 作者单位： | 新疆农业大学农学院,新疆农业大学农业生物技术重点实验室,乌鲁木齐830052 |
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| 基金项目： | 新疆农业大学校前期课题（XJAU201018） |
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| 摘 要： | 从鹰嘴豆中克隆生物节律钟LHY基因的cDNA全长序列,进行序列信息学分析。通过同源克隆策略,利用RT-PCR技术获得核心片段,结合5＇-RACE和3＇-RACE技术,克隆得到鹰嘴豆生物节律钟基因LHY的cDNA全长序列,其核苷酸序列长度为3 061 bp,包括2 220 bp的完整开放阅读框（ORF）,编码739个氨基酸。验证后命名为CarLHY基因,获得基因登录号为KJ558378。生物信息学研究表明CarLHY基因cDNA序列与其他植物LHY基因具有较高的相似性;预测CarLHY蛋白不具有跨膜结构;为转录因子,定位于细胞核中;不具备信号肽。对CarLHY蛋白功能结构域预测表明,蛋白质核心结构存在符合转录因子与DNA结合的常见功能域HTH。蛋白系统进化树显示,与大豆分子进化距离最近,其次是黑杨、拟南芥。
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| 关 键 词： | 鹰嘴豆 LHY基因 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioimformatic Analysis of Full Length cDNA of LHY Gene from Cicer arietinum L. |
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| Institution: | HAN Hui, WANG Xi-dong, YAO Zheng-pei, Xianmusiya Kakan (Key Lab.of Agricultural Biotechnology Xinjiang Agricultural University,College of Agronomy, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cicer arietinum L LHY gene cloning bioinformatic analysis |
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