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中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆
引用本文:谢炳春,黄俊霖,温松森,李 涛,李 颖,徐小万,徐晓美,吴智明,衡 周. 中国辣椒BCAT基因家族鉴定、表达分析及克隆[J]. 广东农业科学, 2022, 49(12): 34-43
作者姓名:谢炳春  黄俊霖  温松森  李 涛  李 颖  徐小万  徐晓美  吴智明  衡 周
作者单位:1. 仲恺农业工程学院园艺园林学院,广东 广州 510225;2. 广东省农业科学院蔬菜研究所 / 广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广东 广州 510640
基金项目:国家自然科学基金(32072598);广东省重点建设学科科研能力提升项目(2021ZDJS004);贵州省自然科学技术基金项目(黔科合基础〔2018〕1184);广东省省级乡村振兴战略专项(粤财农〔2021〕37 号)
摘    要:【目的】了解中国辣椒(Capsicum chinense Jacq.)BCAT基因家族成员的分布、性质及表达模式。中国辣椒是辣椒的5个主要栽培种之一,果实通常具有由支链酯类形成的浓郁果香。支链氨基酸转氨酶(BCAT,Branched-chain Aminotransferase)负责催化支链氨基酸合成相应2-氧代酸,是催化合成支链酯类的第一步反应酶。【方法】使用生物信息学分析和实时荧光定量PCR等方法对中国辣椒的BCAT基因家族成员进行鉴定、表达分析和克隆。【结果】获得5个BCAT基因家族成员,分别命名为CcBCAT1、CcBCAT2、CcBCAT3、CcBCAT4和CcBCAT5,随后对其进行生物信息学分析并克隆CcBCAT1~CcBCAT4。生物信息学分析显示,这些基因分布于辣椒的4条染色体上,蛋白均为亲水性蛋白,氨基酸长度在184~557 aa,分子量为20.29~89.60 ku,等电点为5.57~8.34。亚细胞定位预测结果显示,CcBCAT1定位于叶绿体和线粒体,其他基因家族成员均位于叶绿体。CcBCATs基因时空表达分析显示,CcBCAT1-4基因具有组织表达特异性,Cc...

关 键 词:中国辣椒  支链氨基酸  生物信息学  表达特征  基因克隆

Identification, Expression Analysis and Cloning of Capsicum chinense BCAT Gene Family
XIE Bingchun,HUANG Junlin,WEN Songsen,LI Tao,LI Ying,XU Xiaowan,XU Xiaomei,WU Zhiming,HENG Zhou. Identification, Expression Analysis and Cloning of Capsicum chinense BCAT Gene Family[J]. Guangdong Agricultural Sciences, 2022, 49(12): 34-43
Authors:XIE Bingchun  HUANG Junlin  WEN Songsen  LI Tao  LI Ying  XU Xiaowan  XU Xiaomei  WU Zhiming  HENG Zhou
Abstract:
Keywords:Capsicum chinense   branched-chain amino acids   bioinformatics   expression characteristics   gene cloning
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