家蚕传染性软化病病毒(桐乡株)5′端非编码区基因的克隆及序列分析 |
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引用本文: | 李明乾,苘娜娜,蔡顺风,陈孝学,金伟,鲁兴萌.家蚕传染性软化病病毒(桐乡株)5′端非编码区基因的克隆及序列分析[J].蚕业科学,2009,35(1). |
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作者姓名: | 李明乾 苘娜娜 蔡顺风 陈孝学 金伟 鲁兴萌 |
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作者单位: | 浙江大学动物科学学院无脊椎动物病理学研究室,杭州,310029;浙江大学动物科学学院无脊椎动物病理学研究室,杭州,310029;浙江大学动物科学学院无脊椎动物病理学研究室,杭州,310029;浙江大学动物科学学院无脊椎动物病理学研究室,杭州,310029;浙江大学动物科学学院无脊椎动物病理学研究室,杭州,310029;浙江大学动物科学学院无脊椎动物病理学研究室,杭州,310029 |
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基金项目: | 国家高技术研究发展计划(863计划) |
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摘 要: | 为了探讨家蚕传染性软化病病毒的复制与翻译机制,利用cDNA 5′末端快速扩增(5′-RACE)技术获得了家蚕传染性软化病病毒桐乡分离株(Bombyxmoriinfectious flacherie virus,BmIFV-2)的5′端非编码区(non-coding region,NCR)。序列比较分析发现:BmIFV-2的5′-NCR由155个核苷酸组成,A+U含量达60.64%,其中包含1个起始密码子AUG;与坂城分离株(BmIFV-1)的5′-NCR相比,BmIFV-2的5′-NCR在5′末端缺少1个核苷酸,但核苷酸识别率为100%(即单核苷酸变异率为0),而且这个缺少的核苷酸并不影响其5′-NCR的二级结构。与已经证实具有内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site,IRES)活性的Iflavirus属的2种病毒EoPV(Ectropis obliquapicor-na-like virus)和VDV-1(Varroa destructorvirus 1)的5′-NCR相比,BmIFV的5′-NCR可能也具有IRES活性。
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关 键 词: | 家蚕 传软性软化病毒 5’端非编码区 序列分析 |
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