| 花生AhARF 基因家族鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 唐桂英,彭振英,徐平丽,李鹏祥,朱洁琼,单雷,万书波. 花生AhARF 基因家族鉴定与表达分析[J]. 中国油料作物学报, 2020, 42(6): 1100. DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2020213 |
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| 作者姓名： | 唐桂英 彭振英 徐平丽 李鹏祥 朱洁琼 单雷 万书波 |
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| 作者单位： | 1. 山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生理生态重点实验室，山东济南，250100；2. 山东师范大学生命科学学院，山东济南，250014 |
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| 基金项目： | 山东省农业良种工程（2017LZN035）；山东省重点研发计划（2019GNC106069） |
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| 摘 要： | 生长素响应因子（Auxin response factor，ARF）是生长素信号转导途径中的一类重要转录因子，在种子萌发、器官形成、果实成熟、胚胎发生等多个生长发育过程发挥作用。为了揭示花生基因组中AhARF 基因家族的特征，本研究利用生物信息学方法从花生基因组中鉴定了62个花生AhARF 家族基因，它们不均匀分布于除1号和11号之外的其他18条染色体上，在A和B亚基因组对应关系的染色体上数目大体相同。依据系统发生关系，62个花生AhARFs 与拟南芥AtARFs 家族基因共同聚在除ClassIII（仅包含拟南芥AtARFs）外的其余4个分支。共线性分析共检测到33对片段重复基因，其Ka/Ks比值均小于1，受到环境压力的纯化选择。本研究还分析了它们的理化性质、蛋白保守结构域等特征。此外，基于22个组织转录组数据，绘制了62个花生AhARF 家族基因的表达模式热图。进一步应用qRT-PCR方法，分析了可能与萌发相关的4个AhARF 基因（AhARF10、AhARF20、AhARF23 和AhARF46）的时空表达模式。本研究可为种子萌发相关AhARF 基因的挖掘与功能鉴定提供基础。
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| 关 键 词： | 花生 ARF 基因家族 表达分析 |
Genome-wide identification and expression analysis of auxin response factor gene family in Arachis hypogaea L. |
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| TANG Gui-ying,PENG Zhen-ying,XU Ping-li,LI Peng-xiang,ZHU Jie-qiong,SHAN Lei,WAN Shu-bo. Genome-wide identification and expression analysis of auxin response factor gene family in Arachis hypogaea L.[J]. Chinese Journal of Oil Crop Sciences, 2020, 42(6): 1100. DOI: 10.19802/j.issn.1007-9084.2020213 |
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| Authors: | TANG Gui-ying PENG Zhen-ying XU Ping-li LI Peng-xiang ZHU Jie-qiong SHAN Lei WAN Shu-bo |
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| Affiliation: | 1. Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences/Shandong Provincial Key Laboratoryof Crop Genetic Improvement, Ecology and Physiology, Jinan 250100, China;2. College of Life Sciences, Shandong Normal University, Jinan 250014, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Arachis hypogaea L.；auxin response factor gene family；phylogenic relationship conserved domain of proteins expression pattern analysis |
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