马铃薯StWRKY57基因的生物信息学分析及亚细胞定位

WRKY转录因子对于植物抗逆境胁迫具有重要作用，根据先前进行的转录组测序分析，发现StWRKY57在干旱和盐胁迫条件下被诱导上调表达。以马铃薯StWRKY57为研究对象，进行生物信息学分析、表达分析和亚细胞定位，利用qRT-PCR技术分析其组织特异性和非生物胁迫下的表达情况。StWRKY57基因位于马铃薯第8号染色体上，CDS区长762 bp，属于疏水性非跨膜蛋白；同源性分析显示该蛋白与潘那利番茄SpWRKY40的同源性最高；其启动子区包含光响应元件、胚乳表达、参与昼夜节律和激素响应等相关的顺式作用元件；qRT-PCR分析显示该基因在叶中表达量最高，在200 mmol/L NaCl、20%PEG 6000和100μmol/L脱落酸（Abscisic acid,ABA）处理下，均上调表达；亚细胞定位显示该蛋白定位于细胞核中。该研究为马铃薯StWRKY57基因之后的试验提供了理论依据。