| 荨麻科植物DNA条形码的筛选 |
| |
| 引用本文： | 侯新东,韩大永,曾莉,邢婷婷. 荨麻科植物DNA条形码的筛选[J]. 南方农业学报, 2014, 45(2): 178-183. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2014.2.178 |
| |
| 作者姓名： | 侯新东 韩大永 曾莉 邢婷婷 |
| |
| 作者单位： | 中国地质大学环境学院,武汉,430074 |
| |
| 基金项目： | 中国地质大学(武汉)教学实验室开放基金中央高校基本科研业务费专项资金项目国家自然科学基金青年科学基金 |
| |
| 摘 要： | [目的]评价不同DNA条形码候选序列对荨麻科植物的鉴别能力,为荨麻科植物鉴定提供参考.[方法]使用ITS、matK、rbcL和psbA-trnH绪列的通用引物对荨麻科植物进行PCR扩增和测序,比较各序列的扩增效率、测序成功率,分析获得序列的碱基组成及变异,比较种间和种内变异的差异,并对条形码间距进行评估.[结果]psbA-trnh序列在荨麻科植物13个种30个样品中的扩增成功率最高(100.0%).psbA-trnH的有效序列获得率最高,为95.4%,ITS为92.3%,rbcL为90.1%,matK为零.ITS序列种间遗传距离范围为0~0.508,psbA-trnH序列为0~0.522,rbcL序列为0~0.532.ITS序列在种间、种内的差异变异及条形码间距较rbcL与psbA-trnH具有更明显的优势.ITS序列构建的系统发育树中不同物种形成单系分支的百分比最高,其次为psbA-trnH、rbcL序列.聚类结果表明,MP法的聚类效果最好,其次为UPGMA法、ML法,NJ法最不理想.[结论]荨麻科植物种间变异明显大于种内变异,DNA条形码适用于荨麻科植物种水平上的鉴定;3个候选序列中无任何一个序列可完全鉴别出不同种类的荨麻科植物,ITS、rbcL与psbA-trnH可作为鉴别荨麻科植物的DNA条形码序列组合.
|
| 关 键 词： | 荨麻科植物 DNA条形码 ITS rbcL psbA-trnH matK |
Screening potential DNA barcode regions for Urticaceae plants |
| |
| HOU Xin-dong,HAN Da-yong,ZENG Li,XING Ting-ting. Screening potential DNA barcode regions for Urticaceae plants[J]. Journal of Southern Agriculture, 2014, 45(2): 178-183. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2014.2.178 |
| |
| Authors: | HOU Xin-dong HAN Da-yong ZENG Li XING Ting-ting |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《南方农业学报》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《南方农业学报》下载免费的PDF全文 |
|
