首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析
作者姓名:朱书礼  李新辉  杨计平  李跃飞  李捷  帅方敏  李琳
作者单位:1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东 广州510380; 大连海洋大学,辽宁 大连116023
2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东 广州,510380
基金项目:公益性行业(农业)科研专项经费项目(200903048-05);广西区自然科学基金重大项目(2013GXNSFEA053003);科技部社会公益项目
摘    要:应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼( Ctenopharyngodon idellus)α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2063 bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列进行生物信息学分析,确定了其转录起始区域及转录起始位点( TSS);在TSS上游30 bp处有1个TATA-box,-58 bp处有CCAAT-box;在5'侧翼序列中还发现有GATA-1、OCT-1、GR、HNF-3、AP1和SP1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列的克隆,为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。

关 键 词:草鱼  α-淀粉酶基因  Genome Walking  5'侧翼序
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号