草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析 |
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作者姓名: | 朱书礼 李新辉 杨计平 李跃飞 李捷 帅方敏 李琳 |
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作者单位: | 1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东 广州510380; 大连海洋大学,辽宁 大连116023 2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东 广州,510380 |
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基金项目: | 公益性行业(农业)科研专项经费项目(200903048-05);广西区自然科学基金重大项目(2013GXNSFEA053003);科技部社会公益项目 |
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摘 要: | 应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼( Ctenopharyngodon idellus)α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2063 bp的5'侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%~86%。将草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列进行生物信息学分析,确定了其转录起始区域及转录起始位点( TSS);在TSS上游30 bp处有1个TATA-box,-58 bp处有CCAAT-box;在5'侧翼序列中还发现有GATA-1、OCT-1、GR、HNF-3、AP1和SP1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列的克隆,为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。
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关 键 词: | 草鱼 α-淀粉酶基因 Genome Walking 5'侧翼序 |
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