| 茶树COBRA基因家族全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 艾安涛,李燕丽,章文益,吕立堂. 茶树COBRA基因家族全基因组鉴定及表达分析[J]. 茶叶学报, 2021, 62(3): 95-104. DOI: 10.3969/j.issn.1007-4872.2021.03.001 |
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| 作者姓名： | 艾安涛 李燕丽 章文益 吕立堂 |
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| 作者单位： | 贵州大学茶学院,贵州 贵阳 550025;贵州大学茶学院,贵州 贵阳 550025;湄潭县茶产业发展中心,贵州 湄潭 564100;贵州大学茶学院,贵州 贵阳 550025;贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院,山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室,贵州 贵阳 550025 |
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| 摘 要： | COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子,对植物生长、纤维素含量等有重要作用.本研究通过对茶树基因组数据进行分析,成功的从中鉴定到COBRA基因,并对该基因家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位、进化关系、保守结构域、染色体定位等进行生物信息学分析,同时分析了茶树COBRA成员在PEG诱导的干旱胁迫、茉莉酸甲酯处理、盐胁迫、冷胁迫处理中的转录组数据,最后对茶树进行茉莉酸甲酯处理,基于荧光定量PCR技术的表达水平验证.结果表明:茶树COBRA基因有16个家族成员,相对分子质量24807.70～74813.12,等电点5.43～9.14,亚细胞定位显示在细胞膜和细胞外;根据系统进化树将茶树COBRA基因家族分为5类;保守结构域和motif分析发现相同亚家族的基因结构,保守结构域都属于COBRA基因家族;基因表达分析显示COBRA基因在不同茶树部位和胁迫的表达量有不同差异,说明茶树COBRA基因广泛参与茶树生长发育和非生物胁迫响应.实时荧光定量PCR显示经茉莉酸甲酯处理后,3个CsCOBRA基因表达量趋势大致与转录组数据一致,本研究将为进一步开展茶树COBRA基因家族的功能验证和抗逆作用机理研究等提供参考.
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| 关 键 词： | 茶树 COBRA基因家族 生物信息学 表达量分析 |
Genome-wide Identification and Expressions of COBRA Family in Camellia sinensis |
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| AI An-tao,LI Yan-li,ZHANG Wen-yi,LV Li-tang. Genome-wide Identification and Expressions of COBRA Family in Camellia sinensis[J]. Acta Tea Sinica, 2021, 62(3): 95-104. DOI: 10.3969/j.issn.1007-4872.2021.03.001 |
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| Authors: | AI An-tao LI Yan-li ZHANG Wen-yi LV Li-tang |
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