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基于线粒体COII-LrRNA基因对肾形肾状线虫种内群体的遗传多样性分析
引用本文:邓艳凤,田忠玲,郑经武.基于线粒体COII-LrRNA基因对肾形肾状线虫种内群体的遗传多样性分析[J].农业生物技术学报,2016(4):593-599.
作者姓名:邓艳凤  田忠玲  郑经武
作者单位:1. 浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所,杭州310058;苏州出入境检验检疫局,苏州215021;2. 浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所,杭州,310058
基金项目:国家自然科学基金(No.31371921)和国家重点基础研究发展计划(973计划)(No.2013CB127501)
摘    要:肾形肾状线虫(Rotylenchulus reniformis)是一种植物半内寄生线虫,分布于世界的热带和亚热带地区,是许多蔬菜和热带果树重要的病原线虫.为明确该线虫种内群体的遗传变异,本研究采用序列分析法,对采自浙江(ZJ)、福建(FJ)和重庆(CQ)3个地区的肾形肾状线虫的线粒体COII-LrRNA基因序列进行比较.结果表明,肾形肾状线虫线粒体COII-LrRNA基因片段序列为557~563 bp,AT含量为85.5%,明显高于GC含量.序列分析所得3个群体总的变异位点数、单倍型数、单倍型多样性指数(haplotype diversity,Hd)和核苷酸多样性指数(nucleotide diversity,π)分别为176、40、0.946和0.157 4.分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)结果显示,这3个肾形肾状线虫群体间遗传分化系数为0.058 15,遗传分化程度中等,没有明显的地理隔离.遗传变异结果显示,94.18%的变异来自群体内个体间,只有5.82%的变异发生在群体间.结果说明,我国肾形肾状线虫种群内COII-LrRNA基因序列变异较明显,具有丰富的遗传多样性,且对环境变化的适应能力较强.研究结果丰富了我国肾形肾状线虫的系统发育信息,为肾形肾状线虫危害植物的内在遗传因素的研究提供了资料.

关 键 词:肾形肾状线虫  线粒体DNA(mtDNA)  COII-LrRNA基因  遗传多样性

Genetic Diversity of Intra-species Populations of Rotylenchulus reniformis Based on Mitochondrial COII-LrRNA Gene
Abstract:
Keywords:Rotylenchulus reniformis  mitochondrial DNA(mtDNA)  COII-LrRNA gene  Genetic diversity
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