鸭PPARs启动子扩增、序列比较及其转录因子表达模式的聚类分析 |
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引用本文: | 李彦莹,周天予,杨振,张涛,罗俊,刘贺贺.鸭PPARs启动子扩增、序列比较及其转录因子表达模式的聚类分析[J].农业生物技术学报,2016(12):1890-1899. |
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作者姓名: | 李彦莹 周天予 杨振 张涛 罗俊 刘贺贺 |
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作者单位: | 1. 四川农业大学动物科技学院,温江611130;四川农业大学动物遗传育种研究所,温江611130;2. 四川农业大学动物遗传育种研究所,温江,611130 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(No.31301964)和国家大学生创新性实验计划项目(No.2014012) |
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摘 要: | 过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferators-activated receptors,PPARs)是核激素受体超家族的一员,分α、β/δ、γ3个亚型,是调节细胞生长和分化的重要因子.为了解PPARs各成员在鸭(Anas platyrhynchos)骨骼肌发育中的不同作用,本研究克隆了鸭PPARα、PPARβ和PPARγ基因启动子区,预测其共同转录因子结合位点,用qRT-PCR检测PPARs及共同转录因子在鸭胚及出生后骨骼肌发育过程中的表达,比较表达模式并进行聚类分析.结果表明,扩增出鸭PPARα、PPAEβ和PPARγ启动子序列分别为2 526、1 631和2 942 bp,GenBank登录号分别为KX845431、KX845432和KX845433.鸭PPARs启动子区存在典型的CAAT-box、TATA-box顺式作用元件,预测存在共同的特异性蛋白1(specificity protein 1,Sp1)、核因子κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)和CCAAT增强子结合蛋白(CCAAT/enhancer binding protein alpha,C/EBP-α)转录因子结合位点.PPARs成员在鸭胸肌、腿肌组织中均有表达.在胸肌中,转录因子NF-κB与PPARβ基因的表达模式一致;在腿肌中,Sp1、NF-κB、PPARβ和PPARγ的表达模式一致.PPARs各成员均参与了骨骼肌的发育调控,PPARβ作用可能更大;PPAPβ、PPARγ在鸭骨骼肌发育过程中的功能可能相似;此外,NF-κB可能调控PPARβ在骨骼肌中的表达.研究结果为PPARs基因的表达和功能鉴定提供理论依据.
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关 键 词: | 鸭 过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARs) 启动子 转录因子 聚类分析 |
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