秦巴山区黄牛群体的微卫星DNA遗传多样性 |
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引用本文: | 王斌,昝林森,余横伟,刘红,殷林,胡晓一,刘大清. 秦巴山区黄牛群体的微卫星DNA遗传多样性[J]. 农业生物技术学报, 2016, 0(2): 233-244. DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2016.02.009 |
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作者姓名: | 王斌 昝林森 余横伟 刘红 殷林 胡晓一 刘大清 |
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作者单位: | 1. 西北农林科技大学动物科技学院,杨凌712100;汉中职业技术学院农林系,汉中723000;2. 西北农林科技大学动物科技学院,杨凌712100;国家肉牛改良中心,杨凌712100;3. 西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100;4. 汉中职业技术学院农林系,汉中,723000;5. 镇巴县畜牧兽医工作站,镇巴,723600 |
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基金项目: | 国家高技术研究发展计划(863计划)(No.2013AA102505和No.2011AA100307-02)、国家现代农业产业技术体系(No.CARS-38)、陕西省科技统筹创新工程计划(No.2014KTZB02-02)和陕西省科学技术研究发展计划项目(No.2012NY2-17) |
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摘 要: | 为分析秦巴山区西镇牛、赤崖牛、陨巴牛和宣汉牛4个黄牛(Bos taurus)品种的遗传多样性,本研究以蜀宣花牛和郏县红牛作对照,利用12对微卫星引物对6个黄牛品种的289头黄牛个体进行了遗传多样性检测,统计了各品种的等位基因及频率、有效等位基因数、遗传杂合度、多态信息含量及各群体间遗传距离,并对其进行聚类分析.结果表明,6个黄牛品种在12个微卫星位点共发现110个等位基因,等位基因频率为0.001 6~0.517 3,总群体各位点平均有效等位基因数为2.787 7~7.132 6;各位点多态信息含量为0.5192~0.895 3;平均杂合度为0.667 2~0.724 1.群体间发现特有等位基因11个,基因频率为0.008 1~0.381 6;优势等位基因(P>0.4) 19个,基因频率为0.403 2~0.820 0;共有等位基因41个,占全部等位基因的37.27%,仅有13个共有等位基因为优势等位基因(P>0.4),占37.71%.群体间Nei's遗传一致度为0.596 5~0.840 8,标准遗传距离(Ds)为0.173 5~0.524 7.聚类分析结果显示,6个黄牛品种聚为3类,陨巴牛与宣汉牛首先聚在一起,然后同西镇牛聚在一类;赤崖牛与郏县红牛聚为一类;蜀宣花牛自成一类.研究结果表明,12对微卫星标记可用于秦巴山区黄牛遗传多样性的分析,秦巴山区各黄牛品种遗传多样性丰富,选育程度不同,4个黄牛品种虽然地理分布格局相近,自然环境相似,但亲缘关系并非相近,应为来源不同的品种.因此,西镇牛、赤崖牛、陨巴牛和宣汉牛不宜合并为1个品种.本研究所揭示的秦巴山区黄牛品种的遗传分化特点及亲缘关系,为研究品种的遗传共适应特点,预测杂交优势,制定育种战略等提供了科学依据.
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关 键 词: | 秦巴山区黄牛 微卫星DNA 遗传多样性 |
Genetic Diversity of Microsatellite DNA Among the Cattle (Bos taurus) Population in the Qinling-Bashan Mountain Area |
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Abstract: | |
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Keywords: | The cattle in Qinling-Bashan Mountain area Microsatellite DNA Genetic diversity |
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