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蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位预测
引用本文:杜杰,尹惠琼,杨姝,马玉媛,韦平,章金刚.蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位预测[J].中国动物传染病学报,2013,21(1):29-36.
作者姓名:杜杰  尹惠琼  杨姝  马玉媛  韦平  章金刚
作者单位:1. 广西大学动物科技学院,南宁530005;军事医学科学院野战输血研究所国家生物医学分析中心病毒安全检测实验室,北京100850
2. 军事医学科学院野战输血研究所国家生物医学分析中心病毒安全检测实验室,北京,100850
3. 广西大学动物科技学院,南宁,530005
基金项目:国家科技支撑计划子课题(2008BAI54B06-21)
摘    要:根据前期试验中测得的蓝舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推导的氨基酸序列,利用DNAStar软件和Biosun软件进行生物信息学预测,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合二级结构预测来综合分析蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位.比较两种软件的预测结果发现,在蓝舌病病毒VP7蛋白的381个氨基酸序列中,第81~85、198~202、235~239、253~257区域有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原表位的转角和无规则卷曲,最有可能为蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞线性优势表位.上述预测和判定结果表明,在蓝舌病病毒VP7蛋白序列中存在优势B细胞线型表位,为进一步合成多肽并分析已获得的VP7蛋白单抗的结合表位奠定了基础.

关 键 词:蓝舌病毒VP7蛋白  B淋巴细胞表位  二级结构  预测

PREDICTION OF B CELL EPITOPES IN MAJOR CORE PROTEIN VP7 OF BLUETONGUE VIRUS
DU Jie , YIN Hui-qiong , YANG Shu , MA Yu-yuan , WEI Ping , ZHANG Jin-gang.PREDICTION OF B CELL EPITOPES IN MAJOR CORE PROTEIN VP7 OF BLUETONGUE VIRUS[J].Chinese Journal of Animal Infectious Diseases,2013,21(1):29-36.
Authors:DU Jie  YIN Hui-qiong  YANG Shu  MA Yu-yuan  WEI Ping  ZHANG Jin-gang
Institution:1.College of Animal Science,Guangxi University,Nanning 530005,China;2.Laboratory for Viral Safety of NCBA,Institute of Transfusion Medicine,Academy of Military Medical Sciences,Beijing 100850,China)
Abstract:
Keywords:
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