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蓝舌病病毒、流行性出血病病毒和帕利亚姆血清群病毒三重RT-qPCR检测方法的建立及应用
引用本文:杨振兴,李占鸿,肖雷,谢佳芮,廖德芳,李卓然,李华春,朱建波,杨恒.蓝舌病病毒、流行性出血病病毒和帕利亚姆血清群病毒三重RT-qPCR检测方法的建立及应用[J].华南农业大学学报,2021,42(3):17-25.
作者姓名:杨振兴  李占鸿  肖雷  谢佳芮  廖德芳  李卓然  李华春  朱建波  杨恒
作者单位:云南省畜牧兽医科学院/云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南 昆明 650224
基金项目:国家自然科学基金(31760744);国家重点研发计划(2016YFD0500908,2017YFC1200505);云南省中青年学术和技术带头人后备人才培养项目(2017HB055)
摘    要:目的 建立蓝舌病病毒(Bluetongue virus,BTV)、流行性出血病病毒(Epizootic hemorrhagic disease virus,EHDV)及帕利亚姆血清群病毒(Palyam serogroup virus,PALV)快速筛查和诊断的三重RT-qPCR检测技术。方法 选择BTV的NS3、EHDV的NS1以及PALV的VP7基因作为靶基因,设计3组特异性引物和探针,建立3种病毒的三重RT-qPCR检测方法。对检测方法的灵敏度、特异性和重复性进行验证,同时使用我国分离的BTV、EHDV与PALV不同血清型毒株和对应的阳性血液样本,与24个BTV血清型及6个EHDV血清型参考毒株对该三重法的检测效果进行验证。结果 三重RT-qPCR的扩增效率均可达90%以上,对3种病毒核酸拷贝数的检测下限均为10 μL-1级别,与单重法的检测灵敏度相当;与阿卡斑病毒、小反刍兽疫病毒、口蹄疫病毒和牛流行热病毒之间无交叉反应;Ct值批内、批间变异系数均在2%以内;可检测出24种BTV血清型、6种EHDV血清型与3种PALV血清型,具有群特异性;可有效检测血液中的病毒核酸,检测结果与单重法一致。结论 本研究建立的BTV、EHDV与PALV三重RT-qPCR具有良好的敏感性、特异性和重复性,可用于临床样本中对3种病毒的同时诊断与筛查。

关 键 词:三重RT-qPCR  蓝舌病病毒  流行性出血病病毒  帕利亚姆血清群病毒  病毒检测
收稿时间:2020/7/22 0:00:00

Establishment and application of triplex RT-qPCR for detection of bluetongue virus, epizootic hemorrhagic disease virus and Palyam serogroup virus
YANG Zhenxing,LI Zhanhong,XIAO Lei,XIE Jiarui,LIAO Defang,LI Zhuoran,LI Huachun,ZHU Jianbo,YANG Heng.Establishment and application of triplex RT-qPCR for detection of bluetongue virus, epizootic hemorrhagic disease virus and Palyam serogroup virus[J].Journal of South China Agricultural University,2021,42(3):17-25.
Authors:YANG Zhenxing  LI Zhanhong  XIAO Lei  XIE Jiarui  LIAO Defang  LI Zhuoran  LI Huachun  ZHU Jianbo  YANG Heng
Institution:Yunnan Veterinary and Animal Science Institute/Yunnan Tropical and Subtropical Animal Virus Disease Laboratory, Kunming 650224, China
Abstract:
Keywords:triplex RT-qPCR  bluetongue virus  epizootic hemorrhagic disease virus  Palyam serogroup virus  virus detection
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