猪流行性腹泻病毒湖南分离株ORF3基因克隆与遗传进化分析

为了解湖南省猪流行性腹泻病毒基因变异情况,研究应用RT-PCR技术对湖南某猪场暴发疑似感染PEDV腹泻仔猪中提取肠道病料组织样品进行研究,同时对病原ORF3基因序列进行扩增与分析。结果显示,12份样品中有3份检测为PEDV阳性,其ORF3基因序列均为675bp,无碱基插入或缺失,仅出现个别碱基突变,其与我国流行的PEDV变异株核苷酸序列同源性分别为98.8%～99.9%,但与PEDV疫苗株(CV777)同源性相对较低,仅为95.4%～96.3%;系统进化树分析结果显示此次研究的PEDV分离株与我国流行的PEDV变异株聚为同一分支,与疫苗株所处分支相隔较远。研究结果表明该猪场发生了PEDV变异株的流行,相关防治措施需尽快实施。