江苏地区部分猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒遗传变异分析

为准确了解当前猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)毒株流行趋势和变异，为疫苗研发和使用提供借鉴依据，本研究针对江苏地区部分猪场开展了PRRSV毒株调查。本次调查结果显示，NADC30毒株为优势流行毒株类型。同时，对各毒株主要结构蛋白编码区域ORF5序列进行进化分析，各毒株与经典株VR-2332同源性为83.3%～85.2%,与NADC30毒株同源性为92.4%～92.9%。Nsp2氨基酸序列分析结果显示，Ⅱ/JS2026/2021、Ⅱ/JS2030/2021、Ⅱ/JS2042/2021毒株，与PRRSV经典株VR-2332比对，均存在131个(111+1+19)非连续性氨基酸缺失；Ⅱ/JS1994/2021、Ⅱ/JS2026/2021毒株出现136个(111+5+1+19)氨基酸缺失的新特征。Ⅱ/JS1994/2021和Ⅱ/JS2040/2021毒株全长序列重组分析显示，它们均存在重组现象。其中，Ⅱ/JS2040/2021毒株在40～1 190核苷酸位置存在重组，Ⅱ/JS1994/2021毒株在1～1 482核苷酸位置和11 240～12 154核苷酸位置存在重组。