版纳微型猪近交系AURKC的分子特征及其在睾丸中的转录调控研究

为研究AURKC基因在版纳微型猪近交系（Banna mini-pig inbred line, BMI）精子发生中的功能特性及表达调控，本研究利用RNA-seq技术对BMI 12月龄成年公猪的睾丸进行全转录组测序；采用RT-PCR技术从BMI睾丸获得AURKC全长编码序列，并分析其分子结构、蛋白保守结构域及功能特性，构建多物种氨基酸序列进化树和蛋白互作网络图；利用睾丸全转录组测序数据，借助相关数据库，对AURKC基因进行功能注释，预测调控的ceRNA(competing endogenous RNA，竞争性内源RNA)，并构建转录调控网络。结果表明：AURKC在BMI睾丸中原始平均表达量为721.25，其对应转录本ENSSSCT00000051895.2的平均表达量（TPM）值为18.37，该基因CDS长894 bp(GenBank登录号：OK042305)，编码297个氨基酸，位于猪6号染色体，含7个外显子；氨基酸序列N端亲水，C端疏水，含269个氨基酸组成的结构域S＿TKC，二级结构中无规则卷曲占比最大；进化分析表明，AURKC氨基酸序列在哺乳动物多物种间具有高度的保守性及进化同源...