青海省3个牦牛群体母系遗传多样性、分化及系统发育分析 |
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引用本文: | 白诗睿,马志杰,梅萨,陈生梅,陈付菊,郭卫兴.青海省3个牦牛群体母系遗传多样性、分化及系统发育分析[J].四川农业大学学报,2022(5):664-669. |
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作者姓名: | 白诗睿 马志杰 梅萨 陈生梅 陈付菊 郭卫兴 |
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作者单位: | 1. 青海大学畜牧兽医科学院;2. 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室;3. 青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室;4. 青海大学农牧学院;5. 青海省果洛州班玛县畜牧兽医站 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31960656);;中国科学院“西部之光”人才培养引进计划(“西部青年学者”)项目(3-1); |
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摘 要: | 【目的】从分子水平上探究青海省果洛藏族自治州3个牦牛群体(即达日、玛沁和岗龙群体)的母系遗传多样性水平、分化状况、聚类关系及其遗传背景。【方法】对33头岗龙牦牛线粒体DNA(mtDNA)D-loop区序列进行了测定,后从GenBank中下载了已报道的37条达日牦牛和32条玛沁牦牛的相应序列,对共计102条mtDNA D-loop序列进行综合分析。【结果】根据638 bp D-loop区分析序列间核苷酸变异共确定了32种单倍型,其中达日、玛沁和岗龙牦牛群体分别拥有特有单倍型8、6和8种。3个牦牛群体总的单倍型多样度和核苷酸多样度为0.921±0.014和0.020±0.010,其中岗龙牦牛的单倍型多样度最高(0.951±0.019),达日牦牛的单倍型多样度居中(0.901±0.034),而玛沁牦牛的单倍型多样度最低(0.887±0.033)。岗龙牦牛与达日牦牛(Fst=0.118;Nm=1.869)、玛沁牦牛(Fst=0.129;Nm=1.688)群体间均呈中等遗传分化水平,基因交流贫乏,而达日牦牛和玛沁牦牛间(Fst=0.021;Nm=11.655)分化程度很弱,基因交流相对频繁。达日...
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关 键 词: | 牦牛 mtDNA D-loop区 母系遗传多样性 分化 系统发育 |
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