| 青藏高原小柴旦盐湖微生物群落结构及多样性 |
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| 引用本文： | 刘静,张欣,沈国平,封希媛,龙启福,朱德锐.青藏高原小柴旦盐湖微生物群落结构及多样性[J].水生态学杂志,2017,38(5):55-64. |
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| 作者姓名： | 刘静 张欣 沈国平 封希媛 龙启福 朱德锐 |
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| 作者单位： | 青海大学医学院基础医学研究中心，西宁 810016；北京工业大学计算机学院，北京 100022；,青海大学医学院基础医学研究中心，西宁 810016；,青海大学医学院基础医学研究中心，西宁 810016；,青海民族大学，西宁 810016,青海大学医学院基础医学研究中心，西宁 810016；,青海大学医学院基础医学研究中心，西宁 810016； |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(No.31560039)；青海省科技计划项目(No.2013Z725; No.2015ZJ929Q) |
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| 摘 要： | 通过探究小柴旦盐湖微生物群落结构与多样性,为盐湖微生物资源的开发利用和生态保护提供重要的理论参考依据。利用Illumina Mi Seq测序平台对小柴旦盐湖细菌和古菌的16S rRNA基因(V3~V5区)进行高通量测序,获得细菌和古菌的物种注释OTU(Operational Taxonomic Units)数目分别为870和410,其中分类地位明确的细菌有18门、24纲、135属,古菌2门、4纲、22属。细菌优势类群依次是厚壁菌门(Firmicutes,34.05%)、变形菌门(Proteobacteria,32.91%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,18.01%)和蓝细菌门(Cyanobacteria,8.46%);优势种群依次是芽孢杆菌属(Bacillus,21.53%)、Chloroplast-norank(6.65%)和海杆菌属(Marinobacter,4.05%)。古菌的优势类群和优势种群主要是未确定分类地位的沃斯古菌门(Woesearchaeota DHVEG-6,80.84%),相关的系统分类学尚需深入研究。小柴旦盐湖微生物的种群结构复杂、类群丰富,细菌Shannon多样性指数(4.77±0.45)显著高于古菌(2.79±0.45),且存在大量的新种资源。
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| 关 键 词： | 小柴旦盐湖 高通量测序 微生物多样性 种群结构 聚类分析 |
| 收稿时间： | 2016/12/26 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/9/13 0:00:00 |
Microbial Community Structure and Diversity of Xiaochaidan Salt Lake on the Tibetan Plateau |
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| LIU Jing,ZHANG Xin,SHEN Guo-ping,FENG Xi-yuan,LONG Qi-fu and ZHU De-rui.Microbial Community Structure and Diversity of Xiaochaidan Salt Lake on the Tibetan Plateau[J].Journal of Hydroecology,2017,38(5):55-64. |
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| Authors: | LIU Jing ZHANG Xin SHEN Guo-ping FENG Xi-yuan LONG Qi-fu and ZHU De-rui |
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| Institution: | Research Center of Basic Medical Science, Medical College of Qinghai University, Xining 810016, P.R.China; College of Computer Science, Beijing University of Technology, Beijing 100022, P.R.China;,Research Center of Basic Medical Science, Medical College of Qinghai University, Xining 810016, P.R.China;,Research Center of Basic Medical Science, Medical College of Qinghai University, Xining 810016, P.R.China;,Qinghai Nationalities University, Xining810016, P.R.China,Research Center of Basic Medical Science, Medical College of Qinghai University, Xining 810016, P.R.China; and Research Center of Basic Medical Science, Medical College of Qinghai University, Xining 810016, P.R.China; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Xiaochaidan Salt Lake high-throughput sequencing microbial diversity community structure cluster analysis |
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