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贵州本地山羊POLRMT 基因启动子区SNP 的生物信息学分析
引用本文:孙岩岩,罗卫星,谢海强,宋桃伟,刘彬,蔡惠芬. 贵州本地山羊POLRMT 基因启动子区SNP 的生物信息学分析[J]. 广东农业科学, 2014, 41(12): 110-113
作者姓名:孙岩岩  罗卫星  谢海强  宋桃伟  刘彬  蔡惠芬
作者单位:贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点试验室,贵州贵阳550025
基金项目:教育部促进与美大地区科研合作与高层次人才培养项目(教外司美[2013]1741 号);贵州省农业科技攻关项目(黔科合NY 字[2012]3006 号
摘    要:为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT 启动子区SNP 位点对肉质品质的影响。通过构建DNA 池筛选出SNP 位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG 岛及转录因子。结果表明,POLRMT 基因启动子区存在2 个SNP 位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT 基因核心启动子范围发生改变,SNP 位点导致部分转录因子结合位点消失,MethPrimer预测到CpG 岛增加1 个。

关 键 词:POLRMT 基因;启动子;SNP;贵州本地山羊;大理石纹性状

Bioinformatics analysis on the SNP in promoter regionof POLRMT gene in Guizhou local goat
Abstract:
Keywords:POLRMT gene   promoter   SNP   Guizhou local goats marbling performance
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