贵州本地山羊POLRMT 基因启动子区SNP 的生物信息学分析 |
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引用本文: | 孙岩岩,罗卫星,谢海强,宋桃伟,刘彬,蔡惠芬. 贵州本地山羊POLRMT 基因启动子区SNP 的生物信息学分析[J]. 广东农业科学, 2014, 41(12): 110-113 |
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作者姓名: | 孙岩岩 罗卫星 谢海强 宋桃伟 刘彬 蔡惠芬 |
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作者单位: | 贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点试验室,贵州贵阳550025 |
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基金项目: | 教育部促进与美大地区科研合作与高层次人才培养项目(教外司美[2013]1741 号);贵州省农业科技攻关项目(黔科合NY 字[2012]3006 号 |
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摘 要: | 为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为试验对象,探究肉质相关基因POLRMT 启动子区SNP 位点对肉质品质的影响。通过构建DNA 池筛选出SNP 位点,并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG 岛及转录因子。结果表明,POLRMT 基因启动子区存在2 个SNP 位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT 基因核心启动子范围发生改变,SNP 位点导致部分转录因子结合位点消失,MethPrimer预测到CpG 岛增加1 个。
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关 键 词: | POLRMT 基因;启动子;SNP;贵州本地山羊;大理石纹性状 |
Bioinformatics analysis on the SNP in promoter regionof POLRMT gene in Guizhou local goat |
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Abstract: | |
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Keywords: | POLRMT gene promoter SNP Guizhou local goats marbling performance |
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