| 杨柳科植物叶绿体基因组结构及变异分析 |
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| 引用本文： | 路东晔,张 磊,张国盛,等. 杨柳科植物叶绿体基因组结构及变异分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2020, 48(2): 87-94 |
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| 作者姓名： | 路东晔 张 磊 张国盛 等 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学 林学院,中国林业科学研究院 林业研究所,内蒙古农业大学 林学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31160167）；国家林业公益性行业科研专项（201304206）；内蒙古自治区自然科学基金项目(2018-MS03013) |
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| 摘 要： | 【目的】获取杨柳科叶绿体基因组的结构及序列特征,揭示杨柳科植物的系统发育关系。【方法】利用Excel和本地Blast,分析统计杨柳科已公布的23种植物叶绿体基因组大小、结构组成、基因数量、排列顺序及内含子等信息;同时基于55个共有单拷贝蛋白编码基因,采用NJ法进行系统发育分析。【结果】杨柳科23种植物叶绿体基因组大小在155～159 kb,主要由大单拷贝区(LSC)长度差异引起。各物种基因排列顺序基本一致,均为2个IRs和2个SCs的典型四元组合结构,4个边界主要位于rpl22、ycf1、rps19基因处。psbZ、ycf15、lhbA、infA、trnK、trnG、trnL、trnV、trnI、trnA等基因存在缺失现象,引起基因数量差异。内含子在细胞色素复合物(petB)基因、RNA聚合酶(rpoC2)基因和核糖体蛋白(rpl2)基因等内发生结构变异,引起基因长度差异。系统进化分析结果表明,杨树聚类为4个高支持率进化支,钻天柳等7种柳树分为2个进化支。【结论】叶绿体基因组支持杨属、柳属独立进化,为杨柳科系统分类和系统发育提供了分子证据。
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| 关 键 词： | 杨柳科；叶绿体基因组；基因组结构变异；系统发育 |
| 收稿时间： | 2019-01-25 |
Chloroplast genome structure and variation of Salicaceae plants |
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| LU Dongye,ZHANG Lei and ZHANG Guosheng,et al. Chloroplast genome structure and variation of Salicaceae plants[J]. Journal of Northwest A&F University（Natural Science Edition）, 2020, 48(2): 87-94 |
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| Authors: | LU Dongye ZHANG Lei ZHANG Guosheng et al |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Salicaceae chloroplast genome genome structural variation phylogenetic |
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