| 甜瓜α-甘露糖苷酶基因家族的全基因组分析 |
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| 引用本文： | 乌斯呼吉日嘎拉,赵爱奇,莘少红,郝金凤,哈斯阿古拉. 甜瓜α-甘露糖苷酶基因家族的全基因组分析[J]. 广东农业科学, 2014, 41(12): 144-149 |
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| 作者姓名： | 乌斯呼吉日嘎拉 赵爱奇 莘少红 郝金凤 哈斯阿古拉 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学生命科学学院/内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室, 内蒙古呼和浩特010021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31101559） |
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| 摘 要： | 琢-甘露糖苷酶(琢-mannosidases, 琢-Man)是生物界广泛存在的一种糖苷水解酶。通过已公布的甜瓜基因组数据库预测琢-Man 基因家族成员，其蛋白序列都含有完整的Glyco_hydro_47 或Glyco_hydro_38 保守结构域。再将筛选出的成员与拟南芥、大豆、番茄、可可树、葡萄、黄瓜、马铃薯、谷子的相应基因编码的蛋白序列进行进化分析比对，建立系统发生树和保守基序的预测分析。结果表明，甜瓜基因组中含有8 个琢-man 基因，分为玉类和域类，并分成5 个亚族。同一类成员的蛋白结构域具有较高相似性与保守性，并且大部分成员基序的顺序和种类相同，不同类的成员之间基序差距较大。对甜瓜琢-甘露糖苷酶基因家族的系统分析鉴定，有助于甜瓜琢-甘露糖苷酶基因克隆和功能的进一步研究，为研究其他植物琢-甘露糖苷酶基因家族的功能和进化提供参考依据。
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| 关 键 词： | 甜瓜；琢-甘露糖苷酶；进化分析；生物信息学 |
Genome-wide analysis of mannosidasesfamily genes in Cucumis melo |
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| Keywords: | Cucumis melo -mannosidases phylogenetic analysis bioinformatics |
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