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番茄SlAGO7基因的克隆及表达分析
引用本文:向娅,先志强,林冬波,李正国. 番茄SlAGO7基因的克隆及表达分析[J]. 热带作物学报, 2013, 34(4): 641-647
作者姓名:向娅  先志强  林冬波  李正国
作者单位:重庆大学生命科学学院基因工程研究中心,重庆,400030
基金项目:国家自然科学基金(No. 31071798);科技部863课题(No. 2012AA101702);2010中央高校个人项目(No. CDJXS112300)。
摘    要:根据番茄基因组数据库中AG07的EST序列信息,利用RACE和PCR技术从番茄花cDNA和叶基因组DNA中分别克隆S/A G07的cDNA全长序列和基因组序列,用生物信息学方法对其基因序列特征进行分析;利用Real-time PCR分析S/AG07在整个生长与发育过程中的时空表达模式.结果表明,SlAG07的cNDA全长片段为3 238 bp(GenBank登录号:JX467714),含有3 003 bp的完整开放阅读框,编码1 000个氨基酸,共包含3个外显子和2个内含子.所编码的氨基酸序列含有两个高度保守的PAZ和PIWI结构域,具有典型的AGO类蛋白的结构特征;与已报道的AGO7蛋白序列有较高的同源性;SlAG07基因属于AGO蛋白家族中ZIPPY/AG07亚族.SlAG07在营养组织叶中微弱表达,主要集中在根和茎表达;而在生殖器官花中强烈表达,表达丰度从花蕾到盛开的花呈递增趋势,但在果实不同发育时期中表达都非常微弱甚至不表达.由此推测,SlAG07蛋白可能与番茄花器官的发育相关.这为进一步研究该基因通过ta-siRNA干扰途径来调控番茄花器官发育形成的分子机制奠定了基础.

关 键 词:番茄  SlAGO7  基因克隆  表达分析

Cloning and Expression Analysis of SlAGO7 in Tomato
XIANG Y,XIAN Zhiqiang,LIN Dongbo and LI Zhengguo. Cloning and Expression Analysis of SlAGO7 in Tomato[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2013, 34(4): 641-647
Authors:XIANG Y  XIAN Zhiqiang  LIN Dongbo  LI Zhengguo
Abstract:
Keywords:
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