CODEHOP法设计简并引物克隆鲫鱼肌钙蛋白C(TnC)基因及序列分析 |
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作者单位: | ;1.吉林农业大学动物科学学院;2.吉林省水产科学研究院;3.吉林省卫生监测检验中心 |
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摘 要: | 本文结合生物信息学资源和生物软件的使用,针对特定的氨基酸序列设计简并引物,利用CODEHOP法设计简并引物克隆鲫鱼肌钙蛋白C(Tn C)基因,并构建系统进化树。证明该基因片段与其他鱼类Tn C基因具有较高的同源性,其中与斑马鱼同源性最高达到96%,与大西洋鲑、白斑狗鱼、虹鳟、斜带石斑鱼、斑点叉尾鮰的同源性分别为92%、92%、91%、91%、85%。研究表明,应用此种方法设计出的引物简并度相对较低,Tm值的修改较为灵活,产物特异性强。
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关 键 词: | 鲫鱼 简并引物 CODEHOP 肌钙蛋白C(Tn C) |
CODEHOP Method Design Degenerate Primers Cloning and Characterization of Troponin C gene from Carp |
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