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不同氮效率玉米品种响应氮肥减施的差异表达基因分析
引用本文:李川,张盼盼,张美微,牛军,赵霞,何冠华,乔江方.不同氮效率玉米品种响应氮肥减施的差异表达基因分析[J].河南农业科学,2022(9):10-24.
作者姓名:李川  张盼盼  张美微  牛军  赵霞  何冠华  乔江方
作者单位:1. 河南省农业科学院粮食作物研究所;2. 宝丰县农业科学研究所
基金项目:河南省自然科学基金青年科学基金项目(202300410526);
摘    要:为了研究不同氮效率玉米品种伟科518(氮高效品种,WK518)、农大108(氮低效品种,ND108)在氮减施条件下的差异表达基因(Differently expressed genes,DEG)及其功能,在不同氮条件下正常氮(225 kg/hm2,HN)、低氮(0 kg/hm2,LN)],对灌浆中期WK518和ND108穗位叶进行高通量转录组测序,筛选DEG,进行GO和KEGG富集分析,并对差异表达的转录因子进行分析。结果表明,低氮条件下,在WK518与ND108对比组中共检测到2 065个上调表达基因、2 319个下调表达基因。正常氮条件下,在WK518与ND108对比组中共检测到2 368个上调表达基因、3 780个下调表达基因。WK518在不同氮条件下共检测到1 009个上调表达基因、2 268个下调表达基因。ND108在不同氮条件下共检测到364个上调表达基因、510个下调表达基因。低氮条件下,WK518与ND108中的DEG主要富集于尿卟啉-ⅢC-甲基转移酶活性、甘露糖-6-磷酸异构酶活性、氧化-还原过程、线粒体组织、核染色质等GO条目,氨基糖及核苷酸糖新陈代谢,苯丙氨酸新...

关 键 词:玉米  氮肥减施  氮效率  高通量转录组测序  差异表达基因
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