牡丹根腐病病株和健株根内微生物菌群的差异

为有效防控牡丹根腐病，采用Illumina MiSeq测序技术对牡丹健康及患病植株根部样本中细菌16S rRNA基因V5—V7可变区、真菌ITS基因进行高通量测序分析，以明确牡丹根腐病发病植株和健株根部组织中细菌、真菌菌群结构差异，解析牡丹根腐病的发生机制。结果表明，与健株相比，患病植株中细菌和真菌群落丰富度均降低；真菌种群多样性显著降低，但细菌种群多样性差异不大。细菌优势菌的相对丰度在门、属水平上发生了变化，与健株相比，患病植株中变形菌门（Proteobacteria）相对丰度明显增加，增加了34.03个百分点，厚壁菌门（Firmicutes）相对丰度明显降低，降低了65.00个百分点；在属水平上，链霉菌属（Streptomyces）和固醇杆菌属（Steroidobacter）细菌相对丰度增加，分别增加了3.56、0.38个百分点，而假诺卡氏菌属（Pseudonocardia）细菌相对丰度明显降低，其降低幅度为13.42个百分点。真菌优势菌的相对丰度在在门、属水平上也发生了显著变化，与健株相比，患病植株中担子菌门（Basidiomycota）相对丰度明显增加，增加了9.21个百分点，...