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泥蚶转录因子c-Myc与下游ATP结合盒转运蛋白基因ABCA3启动子的结合鉴定
引用本文:赵德风,陈然,肖国强,滕爽爽.泥蚶转录因子c-Myc与下游ATP结合盒转运蛋白基因ABCA3启动子的结合鉴定[J].浙江农业科学,2023(6):1317-1322.
作者姓名:赵德风  陈然  肖国强  滕爽爽
作者单位:1. 浙江省海洋水产养殖研究所浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室温州市海洋生物遗传育种重点实验室;2. 浙江海洋大学
基金项目:国家自然科学基金项目(31902358);;国家重点研发计划项目(2020YFD0900802,2018YFD0901405-2);;财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-49);
摘    要:为了确定泥蚶转录因子c-Myc(Tgc-Myc)与下游ATP结合盒转运蛋白ABCA3(TgABCA3)基因启动子的结合关系。利用在线生物信息学网站预测以及凝胶电泳迁移(electrophoretic mobility shift assay, EMSA)和染色质免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)技术,对Tgc-Myc与TgABCA3启动子的结合位点进行分析。结果显示,TgABCA3启动子上的E-box顺式作用元件位于-40~-35 bp, Tgc-Myc能够与该序列特异性结合。转录因子Tgc-Myc通过调控TgABCA3基因转录,从而参与泥蚶应对重金属Cd胁迫的响应机制。

关 键 词:泥蚶  转录因子c-Myc  ATP结合盒转运蛋白  E-box  凝胶电泳迁移  染色质免疫共沉淀
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