狂犬病毒GSQY-Dog-China-2013株全基因组序列测定和遗传进化分析

为了全面分析我国狂犬病病毒遗传进化情况，本试验使用反转录PCR(RT-PCR)方法将狂犬病病毒GSQY-Dog-China-2013分为10个片段进行扩增，回收目的片段并与pMD20-T simple载体连接，转化JM109感受态细胞，挑取阳性克隆进行测序；使用DNASTAR软件中的Edit Seq通过拼接相邻片段之间的重叠序列获得GSQY-Dog-China-2013全基因组序列，构建系统进化树进行遗传进化分析。结果显示，GSQY-Dog-China-2013全长11 924核苷酸(nt),包含5个开放阅读框，分别编码核蛋白(N)、磷蛋白(P)、基质蛋白(M)、糖蛋白(G)和转录大蛋白(L);基于全基因组序列的进化树分析显示，GSQY-Dog-China-2013株和国内分离株形成一个分支，在国内分离株中与SXYL15株和SXBJ15株形成一个分支，亲缘关系最接近，提示GSQY-Dog-China-2013可能源自我国陕西省。本试验系甘肃省首次报道狂犬病病毒全基因组序列，进一步丰富了我国狂犬病病毒遗传进化数据，为狂犬病全面防治以及疫苗研发提供了数据支持。