中国大鲵出血症发病原因及致病菌基因组分析 |
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引用本文: | 赵彦华,张世勇,刘洪岩,孙梦玲,薛晖.中国大鲵出血症发病原因及致病菌基因组分析[J].中国兽医杂志,2023(2):21-26. |
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作者姓名: | 赵彦华 张世勇 刘洪岩 孙梦玲 薛晖 |
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作者单位: | 江苏省淡水水产研究所 |
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摘 要: | 为了探明中国大鲵出血症发病原因,本试验采集发病中国大鲵样本,运用16S rDNA序列分析结合细菌生化鉴定,对致病菌进行初步鉴定,利用Illumia测序方法,对致病菌进行全基因组测序,并对基因功能进行注释和预测。结果显示:该病发病原因为细菌感染,致病菌为摩氏摩根菌,对卡那霉素最敏感;该病原菌的基因组测序结果显示,其基因组长度为3.82 Mb,平均G+C含量为51.05%,含有3 732个基因,平均基因长度为895 kb;含有82个tRNA,总长度为6 439 bp,占基因总长度的0.16%,含有22个rRNA,总长度为31 986 bp,占基因总长度的0.83%;共计3 664个蛋白基因获得NR功能注释,并且注释得到1 780条GO功能条目和2 328条KEGG通路条目。本试验结果为中国大鲵出血症的防控和致病机制的研究提供了数据支持。
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关 键 词: | 中国大鲵 摩根氏菌属 细菌 基因组 |
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