猪轮状病毒的分离鉴定和全基因组序列分析 |
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引用本文: | 樊高,申翰钦,王连想,马保华,周庆丰,李群辉,李薇,林丽苗,蔡新斌,张辉华.猪轮状病毒的分离鉴定和全基因组序列分析[J].中国兽医杂志,2023(6):47-54. |
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作者姓名: | 樊高 申翰钦 王连想 马保华 周庆丰 李群辉 李薇 林丽苗 蔡新斌 张辉华 |
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作者单位: | 1. 佛山科学技术学院生命与工程学院;2. 广东省温氏食品集团股份有限公司研究院;3. 佛山海关综合技术中心 |
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摘 要: | 为了解广东省规模化猪场中猪轮状病毒(PoRV)流行毒株的基因特征,本试验在广东省某猪场采集腹泻仔猪肠道组织样品,经实时荧光定量PCR(qPCR)进行病毒初步鉴定;分离获得病毒后,通过间接免疫荧光、电镜观察进一步鉴定,并对分离毒株进行全基因组高通量测序和遗传进化分析。结果显示,qPCR初步鉴定该腹泻仔猪病料为PoRV感染,从阳性病料中分离获得1株能引起典型细胞病变的毒株,在电镜下可观察到似车轮状的病毒颗粒,在倒置荧光显微镜下观察有绿色荧光,将该PoRV分离毒株命名为GD2022,其完整基因型为G9-P23]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1;基因遗传进化分析结果显示,GD2022为人轮状病毒、猪轮状病毒和狗轮状病毒基因组重组后的毒株。本试验结果丰富了PoRV基因组学和分子流行病学相关的研究资料,为轮状病毒防控提供了数据支持。
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关 键 词: | 猪轮状病毒(PoRV) 全基因组测序 腹泻 电镜观察 |
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