| 藏鸡不同发育阶段腿部肌肉组织转录组及microRNA联合分析 |
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| 引用本文： | 袁茂,江明锋,徐亚欧,林亚秋,蒋小松,杨朝武,余春林,李志雄. 藏鸡不同发育阶段腿部肌肉组织转录组及microRNA联合分析[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(12): 2400-2412. DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.12.004 |
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| 作者姓名： | 袁茂 江明锋 徐亚欧 林亚秋 蒋小松 杨朝武 余春林 李志雄 |
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| 作者单位： | 1. 西南民族大学生命科学与技术学院 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室, 成都 610041;2. 西南民族大学生命科学与技术学院 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室, 成都 610041;3. 四川省畜牧科学研究院, 成都 610066 |
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| 基金项目： | 四川省“十三五”畜禽育种攻关项目（2016NYZ0043）；四川省应用基础项目（2016JY0068）；中央高校基本科研业务费专项资金项目（2018NQN10） |
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| 摘 要： | 旨在从转录组和miRNA角度探讨藏鸡肌肉发育的调控机制，了解藏鸡肌肉发育的特殊性。本研究对120和150日龄藏鸡的肌肉组织进行转录组和small RNA测序，筛选出两个日龄阶段差异表达的基因和miRNA，并利用qRT-PCR技术对测序结果进行验证。结果，共筛选出1 691个差异表达基因，其中上调基因330个，下调基因1 361个。差异表达miRNA共有22个，其中9个上调，13个下调。随机选择的5个基因和miRNAs的qPCR验证结果表明表达趋势与测序结果一致。GO富集分析显示，在富集前10的条目中，与免疫相关的条目占较大比例。KEGG分析结果显示，在19个显著富集通路中，与免疫相关的通路占较大比例，且83个miRNA的靶基因出现在显著富集通路上。转录组和small RNA测序数据联合分析表明，343个miRNA-mRNA对为负相关调控模式。本研究从多组学层面为进一步理解藏鸡的肌肉发育提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 藏鸡 肌肉发育 转录组 miRNA |
| 收稿时间： | 2019-05-16 |
Analysis of Transcriptome and microRNA in Leg Muscle of Tibetan Chicken at Different Developmental Stages |
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| YUAN Mao,JIANG Mingfeng,XU Ya'ou,LIN Yaqiu,JIANG Xiaosong,YANG Chaowu,YU Chunlin,LI Zhixiong. Analysis of Transcriptome and microRNA in Leg Muscle of Tibetan Chicken at Different Developmental Stages[J]. Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences, 2019, 50(12): 2400-2412. DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.12.004 |
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| Authors: | YUAN Mao JIANG Mingfeng XU Ya'ou LIN Yaqiu JIANG Xiaosong YANG Chaowu YU Chunlin LI Zhixiong |
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| Affiliation: | 1. Key Laboratory of Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation and Utilization of Ministry of Education, College of Life Science and Technology, Southwest Minzu University, Chengdu 610041, China;2. Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation and Utilization Key Laboratory of Sichuan Province, College of Life Science and Technology, Southwest Minzu University, Chengdu 610041, China;3. Sichuan Animal Science Academy, Chengdu 610066, China |
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| Abstract: | |
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