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香猪卵巢RARRES1基因第1外显子CG位点的甲基化及其与基因差异表达的关联
引用本文:阮亦麒,李大鹏,冉雪琴,毛宁,易凡利,张福平,王嘉福. 香猪卵巢RARRES1基因第1外显子CG位点的甲基化及其与基因差异表达的关联[J]. 中国畜牧兽医, 2018, 45(6): 1471-1478. DOI: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2018.06.006
作者姓名:阮亦麒  李大鹏  冉雪琴  毛宁  易凡利  张福平  王嘉福
作者单位:1. 贵州大学动物科学学院/农业生物工程研究院, 贵阳 550025;
2. 铜仁学院, 铜仁 554300
基金项目:国家自然科学基金(31672390);国家高技术研究发展计划(863计划)课题(2013AA102503);贵州省农业攻关项目(黔科合支撑[2017]2585、黔科合支撑[2017]2587);贵州省"百"层次创新型人才项目(黔科合人才2016-4012号)
摘    要:为验证和探索香猪卵巢转录组RNA测序检测到的视黄酸受体应答1(retinoic acid receptor responder 1,RARRES1)基因在香猪高、低产仔组之间差异表达的原因,本试验针对RARRES1基因第1外显子ATG下游富含CpG位点区段设计特异性引物,采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)研究卵巢RARRES1基因中的甲基化修饰水平;利用实时荧光定量PCR方法检测高、低产仔组香猪卵巢RARRES1基因的表达量,并探究其与基因甲基化水平之间的相关性。结果表明,与低产仔组相比,香猪高产仔组的甲基化水平较高;4个CpG位点均未被甲基化(CpG_7、CpG_11、CpG_12和CpG_15),另外3个CpG位点(CpG_8、CpG_17和CpG_18)基本上全部发生了甲基化。此外,与低产仔组相比,香猪高产仔组中CpG_4(P>0.05)、CpG_9(P<0.05)和CpG_16(P<0.05)位点的甲基化占比较高,而CpG_6位点在香猪低产仔组中的甲基化比例较高,两组差异极显著(P<0.01)。实时荧光定量PCR结果显示,高产仔组香猪RARRES1基因的表达水平较高(P<0.05)。Spearman相关分析结果显示,CpG_9和CpG_16两个位点的甲基化比例与RARRES1基因的表达水平高度正相关(R2=0.896,P<0.01),提示这两个位点的甲基化可能是香猪高产仔组RARRES1基因表达量较高的原因。

关 键 词:香猪  卵巢  RARRES1基因  甲基化  表达量  

The Methylation in the Exon 1 of RARRES1 Gene and its Association with Gene Differential Expression of Xiang Pig Ovary
RUAN Yiqi,LI Dapeng,RAN Xueqin,MAO Ning,YI Fanli,ZHANG Fuping,WANG Jiafu. The Methylation in the Exon 1 of RARRES1 Gene and its Association with Gene Differential Expression of Xiang Pig Ovary[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2018, 45(6): 1471-1478. DOI: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2018.06.006
Authors:RUAN Yiqi  LI Dapeng  RAN Xueqin  MAO Ning  YI Fanli  ZHANG Fuping  WANG Jiafu
Affiliation:1. College of Animal Science, Institute of Agricultural Bioengineering, Guizhou University, Guiyang 550025, China;
2. Tongren University, Tongren 554300, China
Abstract:
Keywords:Xiang pig  ovary  RARRES1 gene  methylation  expression level  
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