猴樟CbMYB308转录因子基因克隆及生物信息学分析 |
| |
引用本文: | 胡甜,叶苏梅,郝瑷滢,王艺润,韩浩章,张颖,王晓李,张丽华.猴樟CbMYB308转录因子基因克隆及生物信息学分析[J].安徽农学通报,2023(3):14-17. |
| |
作者姓名: | 胡甜 叶苏梅 郝瑷滢 王艺润 韩浩章 张颖 王晓李 张丽华 |
| |
作者单位: | 宿迁学院 |
| |
摘 要: | 为研究猴樟CbMYB308蛋白的序列结构和功能,该文克隆猴樟CbMYB308基因CDS序列,进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到的序列具有1个942 bp完整的ORF框,编码313个氨基酸,与沉水樟中收录的RWR91885.1基因序列一致性达97.29%,系统进化树的结果表明,猴樟CbMYB308蛋白具有较高的保守性;猴樟CbMYB308蛋白生物信息学分析结果表明,CbMYB308蛋白具有PLN03091家族结构域,为R2R3-MYB型转录因子,CbMYB308蛋白化学分子式为C1496H2356N432O489S11,相对分子量34.57 kDa,理论等电点6.12,结构不稳定,无序化特征明显,为脂溶性和亲水性蛋白,磷酸化氨基酸位点有53个,亚细胞定位预测为细胞核。
|
关 键 词: | 猴樟 转录因子 基因克隆 生物信息学分析 |
|
|