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应用抑制性差减杂交技术分离椪柑枯水相关基因
引用本文:杨明,王日葵,周炼,葛文东,焦雁翔.应用抑制性差减杂交技术分离椪柑枯水相关基因[J].中国农业科学,2012,45(5):917-925.
作者姓名:杨明  王日葵  周炼  葛文东  焦雁翔
作者单位:1.西南大学园艺园林学院,重庆 400715 2.中国农业科学院柑桔研究所,重庆 400712 3.西南大学食品科学学院,重庆 400715
基金项目:重庆市自然科学基金项目(CSTC,2010BB1154);重庆市科技攻关项目(CSTC,2011AC1023);国家公益性行业(农业)科研专项(201203034)
摘    要:【目的】探索椪柑枯水分子机理,寻找柑橘枯水应答基因,为柑橘枯水防治奠定基础。【方法】利用抑制性差减杂交技术以椪柑正常果肉cDNA作为Driver,以枯水果肉cDNA作为Tester构建正向差减文库。【结果】挑选了300个有效克隆进行测序分析,260个测序成功。经BLASTx比对分析,197条表达序列标签(ESTs)找到了分属于52个基因的同源序列;63条ESTs同源性较低或没有同源性。对文库中编码β-微管蛋白、衰老相关蛋白、细胞色素c、半胱氨酸蛋白酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、转运蛋白、天冬氨酸蛋白酶前体、WRKY转录因子21的基因进行实时定量RT-PCR验证,结果显示这8个基因均明显上调表达。这些差异性表达基因主要涉及衰老、抗逆防御、几丁质和细胞壁代谢、蛋白降解等过程。【结论】通过构建椪柑果肉枯水正向文库,得到一些与枯水相关的基因,这些基因反映了果实对枯水的调控情况,可作为今后防治枯水病害的候选基因。

关 键 词:椪柑  抑制性差减杂交  枯水  表达序列标签  差减文库  聚类分析  
收稿时间:2011-08-22

Molecular Cloning of Waterless-Related Genes in Ponkan Mandarin Using Suppression Subtractive Hybridization
YANG Ming , WANG Ri-kui , ZHOU Lian , GE Wen-dong , JIAO Yan-xiang.Molecular Cloning of Waterless-Related Genes in Ponkan Mandarin Using Suppression Subtractive Hybridization[J].Scientia Agricultura Sinica,2012,45(5):917-925.
Authors:YANG Ming  WANG Ri-kui  ZHOU Lian  GE Wen-dong  JIAO Yan-xiang
Institution:1College of Horticulture and Landscape Architecture,Southwest University,Chongqing 400715;2 Citrus Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Chongqing 400712;3College of Food Science,Southwest University,Chongqing 400715)
Abstract:
Keywords:Ponkan Mandarin  suppression subtractive hybridization  waterlessness  expressed sequence tags  subtractive library  gene ontology
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