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鸭腺苷琥珀酸裂解酶基因序列特征及表达与肌肉肌苷酸含量的相关性分析
引用本文:徐善金,虞德兵,汪峰,何宗亮,张剑锋,于海龙,杜文兴.鸭腺苷琥珀酸裂解酶基因序列特征及表达与肌肉肌苷酸含量的相关性分析[J].中国农业科学,2012,45(4):774-785.
作者姓名:徐善金  虞德兵  汪峰  何宗亮  张剑锋  于海龙  杜文兴
作者单位:1.南京农业大学动物科技学院,南京 210095 2.南京市畜牧家禽科学研究所,南京 210036
基金项目:教育部高校博士点基金(B200928);江苏省自然科学基金(SBK201021501);江苏省农业综合开发产业化经营项目(320111291);南京市科技发展计划项目(2010sd210013)
摘    要:【目的】克隆鸭腺苷琥珀酸裂解酶(adenylosuccinate lyase,ADSL)基因的完整编码区(coding sequences,CDS),对其进行核酸和蛋白序列分析,研究该基因在各品种肌肉组织mRNA表达水平;对该基因mRNA表达水平与肌肉组织肌苷酸(inosine monophosphate acid,IMP)含量进行相关性分析。为揭示中国优良地方鸭种的风味基因结构、研究其生物学功能以及与重要风味物质的关系奠定理论基础。【方法】通过PCR扩增和克隆测序获得鸭ADSL基因部分cDNA序列,运用生物信息学方法分析鸭ADSL基因编码区序列、蛋白结构和进化关系,利用real-time-PCR技术检测鸭肌肉组织中ADSL基因mRNA表达水平,利用高效液相色谱法测定肌肉组织IMP含量。【结果】①鸭ADSL基因CDS全长均为1 380 bp,编码459个氨基酸,与鸡的同源性为94.77%。②ADSL蛋白为偏碱性,有较为强烈的信号肽和细胞内跨膜结构,蛋白二级结构主要由α-螺旋构成。③鸭和鸡首先聚为一类,后与人、鼠等哺乳动物聚为一类,而与两栖、鱼类相聚较远。④ADSL基因表达量品种间差异极显著(P<0.01);各品种内雌性表达量极显著高于雄性(P<0.01);同一性别内胸肌表达量极显著高于腿肌(P<0.01)(樱桃谷鸭除外,为P>0.05)。⑤IMP含量在品种间差异极显著(P<0.01);各品种内雌性含量显著高于雄性(P<0.05);同一性别内胸肌含量显著高于腿肌(P<0.05)。【结论】鸭ADSL基因CDS序列与鸡的同源性极高,在肌肉组织中该基因的表达量及对应IMP含量表现为不同品种、同一品种不同性别、同一性别不同部位间极显著或显著差异,两者并显现出显著正相关。

关 键 词:  ADSL  克隆  mRNA表达  肌苷酸  高效液相色谱法  
收稿时间:2011-03-07

Analysis of Sequence Characters of ADSL Gene and Correlation between Gene Expression and IMP Content in Duck
XU Shan-jin , YU De-bing , WANG Feng , HE Zong-liang , ZHANG Jian-feng , YU Hai-long , DU WEN-xing.Analysis of Sequence Characters of ADSL Gene and Correlation between Gene Expression and IMP Content in Duck[J].Scientia Agricultura Sinica,2012,45(4):774-785.
Authors:XU Shan-jin  YU De-bing  WANG Feng  HE Zong-liang  ZHANG Jian-feng  YU Hai-long  DU WEN-xing
Institution:1(1College of Animal Science and Technology,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095;2Nanjing Husbandry and Poultry Research Institute,Nanjing 210036)
Abstract:
Keywords:duck  adenylosuccinate lyase  cloning  mRNA expression  IMP  high-performance liquid chromatography
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